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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 存放12年的土壤风干样品中，DNA降解了吗？
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wangsichu

铜虫 (初入文坛)

[交流] 存放12年的土壤风干样品中，DNA降解了吗？

2005年、2007年、2010年、2013年、2015年分别采集的土壤样品，风干后一直在南方室温下保存，今年送到公司去测了16S和ITS，公司说DNA提出来了，也给出了测序结果。
请问这种情况下DNA会不会很大程度上降解？不同微生物的DNA链降解的程度一样吗？这个结果可以用吗？
本人刚刚接触分子生物学，请大神解释的浅显点
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1楼 2017-11-20 10:50:14
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美亿美生物

捐助贵宾 (职业作家)
★
wangsichu(金币+1): 谢谢参与
这个，还真说不好，假设有100个菌，按照理论放置时间推算，越久那么含量少的菌就慢慢降解，最后能得到的结果也越少，采集的数据就越少，得出的结论也越偏差。

发自小木虫IOS客户端
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2楼2017-11-20 11:27:55
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小马科研部落

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
室温下保存……
只能说明你的样本，已经不能反映05、07、10、13、15年当时采集时，土壤微生物的种类和相对丰度了。
正常情况下，应该是采集了样本，放到-80冰箱进行保存，抑制微生物的生长发育。
目前的问题是，土已经放在室温了，里面肯定会有细菌和真菌的，所以DNA提出来，并且16S和ITS可以测出来，很正常。
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7楼2017-12-15 16:43:18
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nono20093楼
2017-11-22 06:39   回复  
wangsichu(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
sz_kebaoyuan4楼
2017-11-22 10:53   回复  
wangsichu(金币+1): 谢谢参与
绽放20145楼
2017-11-22 11:40   回复  
wangsichu(金币+1): 谢谢参与
雾霾天20136楼
2017-11-22 18:13   回复  
wangsichu(金币+1): 谢谢参与
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