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chhge

金虫 (正式写手)

[交流] 怎么确认C-H...Pi的距离

请问在计算C-H...Pi时怎么准确计算H到芳环C以及H到芳环中心的距离?谢谢!
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)


waiy2001(金币+1,VIP+0):学习 2-24 23:25
platon自动计算一下,即在platon中点击“cacu all"会出现一个lis文件,在其中就可以找到你要的东西。如果程序认为没有这种作用,那么你可能在lis文件中就找不到下面的东西:

====================================================================================================================================

Analysis of Y-X...Cg(Pi-Ring) Interactions (X..Cg < 4.0 Ang. - Gamma <  30.0 Deg)
====================================================================================================================================

   Y--X(I)    Res(I)   Cg(J)  [   ARU(J)]       X..Cg  Transformed J-Plane P, Q, R, S  X-Perp Gamma      Y-X..Cg        Y..Cg Y-X,Pi

C(19)  -Cl(1)  [ 1] -> Cg(5)  [  2564.02]    3.626(5)   0.9324 0.3227-0.1629  10.9734  3.614   4.66      93.9(3)    4.118(10)   0.72
C(39)  -Cl(2)  [ 2] -> Cg(1)  [  4555.01]    3.623(5)   0.3308-0.9275 0.1743   4.7128  3.612   4.63      93.7(4)    4.126(10)   0.91
                                              -------                                 ----------------------------------------------
                                    Min or Max  3.623                                  3.612   4.63        93.90        4.118   0.91

[  2564] = X,1-Y,-1/2+Z
[  4555] = 1/2+X,1/2-Y,1/2+Z

The Cg(I) refer to the Ring Centre-of-Gravity numbers given in () in the Ring-Analysis above
2楼2009-02-24 16:23:44
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