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perffy13

金虫 (初入文坛)

[求助] TargetScan预测miRNA靶基因,Context+一般取哪个范围,预测评价最可靠?

各位大神们好,最近在用TargetScan预测miRNA的靶基因,比如一个miRNA预测出了400+的靶基因,Context+这个值从-0.8到0.1这个范围内,一般来说Context+越负越好,预测可能性越大。

那么做了靶基因预测之后我要挑选预测的靶基因做GO和pathway分析,这个时候如果把所有的400+靶基因输进去,有些预测可能性很小的基因也会进行通路富集,这样就扩大了结果造成假阳性。

所以打算选择部分预测可能性大的靶基因去分析,那么,如果我以Context+这个值为参考,一般要选择Context+小于多少的靶基因,这个值一般取多少?有没有文献支持的设定值,谢谢!!!

TargetScan预测miRNA靶基因,Context+一般取哪个范围,预测评价最可靠?
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渡创

金虫 (小有名气)

顶,我最近也遇到了同样的问题!
2楼2017-12-21 14:55:21
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临床碎月

新虫 (著名写手)

mark一下吧
3楼2019-03-27 15:37:06
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