24小时热门版块排行榜    

查看: 9484  |  回复: 2

perffy13

金虫 (初入文坛)

[求助] TargetScan预测miRNA靶基因,Context+一般取哪个范围,预测评价最可靠?

各位大神们好,最近在用TargetScan预测miRNA的靶基因,比如一个miRNA预测出了400+的靶基因,Context+这个值从-0.8到0.1这个范围内,一般来说Context+越负越好,预测可能性越大。

那么做了靶基因预测之后我要挑选预测的靶基因做GO和pathway分析,这个时候如果把所有的400+靶基因输进去,有些预测可能性很小的基因也会进行通路富集,这样就扩大了结果造成假阳性。

所以打算选择部分预测可能性大的靶基因去分析,那么,如果我以Context+这个值为参考,一般要选择Context+小于多少的靶基因,这个值一般取多少?有没有文献支持的设定值,谢谢!!!

TargetScan预测miRNA靶基因,Context+一般取哪个范围,预测评价最可靠?
2017-11-15_192310.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渡创

金虫 (小有名气)

顶,我最近也遇到了同样的问题!
2楼2017-12-21 14:55:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

临床碎月

新虫 (著名写手)

mark一下吧
3楼2019-03-27 15:37:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 perffy13 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 340求调剂 +4 话梅糖111 2026-03-24 4/200 2026-03-24 21:41 by yuyu98412
[考研] 一志愿华东理工大学081700,初试分数271 +5 kotoko_ik 2026-03-23 6/300 2026-03-24 10:29 by 学术搬砖er
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-23 4/200 2026-03-23 21:25 by pswait
[考研] 生物学一志愿985,分数349求调剂 +6 zxts12 2026-03-21 9/450 2026-03-23 18:37 by macy2011
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分,求调剂 +5 jiajunX 2026-03-22 5/250 2026-03-23 18:07 by YMU施老师
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +3 Promise-jyl 2026-03-23 3/150 2026-03-23 13:43 by wangkm
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-18 6/300 2026-03-22 20:18 by edmund7
[考研] 一志愿北京化工大学070300 学硕336求调剂 +5 vv迷 2026-03-21 8/400 2026-03-22 14:20 by ColorlessPI
[考研] 318求调剂 +4 plum李子 2026-03-21 7/350 2026-03-22 14:17 by ColorlessPI
[基金申请] 山东省面上项目限额评审 +4 石瑞0426 2026-03-19 4/200 2026-03-22 08:50 by Wei_ren
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 求助 +5 梦里的无言 2026-03-21 6/300 2026-03-21 17:51 by 学员8dgXkO
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-20 3/150 2026-03-21 16:46 by barlinike
[考研] 0805材料320求调剂 +3 深海物语 2026-03-20 3/150 2026-03-21 15:46 by 无际的草原
[考研] 一志愿华中科技大学,080502,354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大,求调剂 +5 材化逐梦人 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:26 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 eation27 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:32 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见