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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 突变位点如何定位于哪一个外显子上
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风铃双鱼

金虫 (小有名气)

[求助] 突变位点如何定位于哪一个外显子上

如何查找突变位点位于多个外显子的哪一个外显子？

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1楼 2017-11-13 20:50:21
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yesucao

木虫 (正式写手)
首先确认基因参考的是哪个版本的序列，对应的转录本是哪个，最后通过突变位点前后序列碱基就可以定位在具体哪个外显子上了

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2楼2017-11-13 21:34:18
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风铃双鱼

金虫 (小有名气)
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2楼: Originally posted by yesucao at 2017-11-13 21:34:18
首先确认基因参考的是哪个版本的序列，对应的转录本是哪个，最后通过突变位点前后序列碱基就可以定位在具体哪个外显子上了

知道一个正常基因，也知道该基因的突变位点，你知道我去哪里查位于哪个外显子吗？还有一般正常基因可以通过cnki去查吧？

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3楼2017-11-13 22:04:36
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咖啡小屋~~

新虫 (正式写手)
一个基因可以对应不同的转录本，一般应该是用ncbi吧

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风铃双鱼
每天进步一点点
4楼2017-11-13 22:15:59
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风铃双鱼

金虫 (小有名气)
送红花一朵
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4楼: Originally posted by 咖啡小屋~~ at 2017-11-13 22:15:59
一个基因可以对应不同的转录本，一般应该是用ncbi吧

这样的你看啊，真核生物一个结构基因包括多个外显子和多个内含子，我已经查了序列知道在2145c>T，这个是表示整个外显子的基因的第2145个位点发生点突变，那我如何确定这是哪个外显子，是编码什么的吗？

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5楼2017-11-13 22:21:39
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风铃双鱼

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 风铃双鱼 at 2017-11-13 22:04:36
知道一个正常基因，也知道该基因的突变位点，你知道我去哪里查位于哪个外显子吗？还有一般正常基因可以通过cnki去查吧？
...

怎么给你金币实在不会用这个小木虫

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6楼2017-11-13 22:48:36
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咖啡小屋~~

新虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 风铃双鱼 at 2017-11-13 22:21:39
这样的你看啊，真核生物一个结构基因包括多个外显子和多个内含子，我已经查了序列知道在2145c>T，这个是表示整个外显子的基因的第2145个位点发生点突变，那我如何确定这是哪个外显子，是编码什么的吗？
...

单从你给的信息，我想不到，怎样查到在哪个外显子上，同意二楼中说的，结合序列来确定，还有之前见过GTF文件，里面包含转录本，外显子，自己位置基因什么的，你可以了解下

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风铃双鱼
每天进步一点点
7楼2017-11-13 22:49:25
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风铃双鱼

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 咖啡小屋~~ at 2017-11-13 22:49:25
单从你给的信息，我想不到，怎样查到在哪个外显子上，同意二楼中说的，结合序列来确定，还有之前见过GTF文件，里面包含转录本，外显子，自己位置基因什么的，你可以了解下
...

再次感谢，啥也不会

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8楼2017-11-14 07:26:42
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