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martin7

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请问关于分子模拟的小问题

各位虫友老板最近突然想做一下反应的计算模拟,我之前是有外面用过vasp和gaussion,但是现在老板不想买软件,想让我用蒙特卡罗方法模拟,我想问以下几个问题:
1,蒙特卡罗方法在应用的时候是有现成的软件吗?还是基本的C++或者matlab就可以实现,那晶体的结构如何画出来呢?
2,蒙特卡罗方法的适用范围有多大?
3,简单说进行化学反应的模拟可以用蒙特卡罗方法吗?
4,vasp和gaussion的软件都是多少钱?
不知道是不是话有点啰嗦,希望大家能给予支持和回答

[ Last edited by martin7 on 2009-2-23 at 11:07 ]
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martin7

银虫 (小有名气)

非常感谢您的回复
我想研究的是反应动力学,想获得能级,电子转移等参数,主要想在微观分子尺度获得,按照您的说法,我想问可以用蒙特卡罗获得这些信息吗?获得的话我们需要做多少努力?
比方说:
1,自己编程序大概需要多少条语句。
2,有现成的软件,大概多少钱
我的问题的目的是想说我现在立项里面可不可以把这个计算工作放里面,我想我现学这个编程不一定来得及,难道蒙特卡罗计算的时候不需要考虑分子之间的各种势的相互影响吗?这些东西的设计估计不是一两个月可以学会的吧?
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4楼2009-02-23 12:08:32
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martin7

银虫 (小有名气)

gwdavid(金币+0,VIP+0):呵呵,改对了!欢迎常来分子模拟版 2-23 18:28
不知道改对了吗,版主帮忙看看,我没用过蒙特卡罗,可以实现吗?谁用过呢?
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2楼2009-02-23 10:58:04
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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yuhuobuku(金币+5,VIP+0):欢迎参加讨论 2-23 11:41
martin7(金币+10,VIP+0):谢谢 2-23 12:01
不想花钱,或者象我一样没钱,可以用免费软件啊。
买不起高斯,可以用Gamess,免费的,功能跟gaussion差不多,一般情况下Gaussion能算的,它也基本能算。

买不起Vasp,可以用Abinit,也可以用PWSCF,还有CPMD,这三个软件加起来,Vasp能算的它们都能算,Vasp不能算的,它们也可以算,问题就是在于,对于有的体系,要自己建势函数,这个比较烦。

要用蒙特卡罗,也是有免费软件的,比如towhee等。但是你要模拟的是化学反应,我估计Towhee不一定能行。

以下具体回答问题:
1,蒙特卡罗方法在应用的时候是有现成的软件吗?还是基本的C++或者matlab就可以实现,那晶体的结构如何画出来呢?
——有。我上面说了。你用C++或Matlab自己编也是可以的,但编程需要时间。画晶体结构的免费软件多如牛毛。

2,蒙特卡罗方法的适用范围有多大?
——很大很大。从量子力学研究、电子输运模拟,再到固液体结构等原子尺度模拟,再到晶体生长等介观尺度,再到宏观热力学、反应动力学等问题,再到经济学、人口学、管理学等社会科学的问题,都可以用Monte Carlo方法处理,但是涉及的领域不同,用到的理论不一样,程序也完全不相同。

3,简单说进行化学反应的模拟可以用蒙特卡罗方法吗?
——原则上是可以的,但一个化学反应可以从不同角度来研究,是分子尺度层面,还是宏观动力学层面?

4,vasp和gaussion的软件都是多少钱?
——这个不很清楚。Vasp好像几万人民币(数千欧元)的样子。Gaussion不知道。
3楼2009-02-23 11:36:09
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martin7

银虫 (小有名气)

我可能说麻烦了
就是说蒙特卡罗方法可行吗?工作量有多大?是现在比较方便的方法吗?和vasp比较呢?我看了一些资料,好像蒙特卡罗方法也有很多近似,这些都是免费的函数参考吗?
本人喜欢负分,希望别给我加分谢谢
5楼2009-02-23 12:15:10
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