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汕头大学海洋科学接受调剂

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xjy5412

新虫 (初入文坛)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 498.3
帖子: 13
在线: 9.9小时
虫号: 3631270
注册: 2015-01-06
专业: 化学工程及工业化学

[求助] 用Lammps做ReaxFF动力学模拟已有1人参与

用Lammps做ReaxFF动力学模拟，怎么统计反应过程中分子的分布情况呢？用lammps自带的命令能统计吗？

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各位老师好，求调剂，本科211，一志愿天津大学生物与医药学硕，差两名录取。已经有9人回复

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1楼 2017-10-24 14:26:36

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

wuhaigang

木虫 (著名写手)

奋斗的虫虫

模拟EPI: 1
应助: 55 (初中生)
金币: 319.9
散金: 2532
红花: 18
帖子: 1043
在线: 551.1小时
虫号: 530526
注册: 2008-03-22
性别: GG
专业: 半导体材料

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

第一，无论怎么样，你的同类元素都会产生不同的原子类型，而lammps是不会进行相应项的合并的，例如C1C5，不会产生C6这种结果，需要自己编程提取每个节点的分子片段。
第二，使用reax/pieces，或者类似的，产生时间点下的分子片段统计，详细看manual

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