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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 用Lammps做ReaxFF动力学模拟
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xjy5412

新虫 (初入文坛)

[求助] 用Lammps做ReaxFF动力学模拟 已有1人参与

用Lammps做ReaxFF动力学模拟，怎么统计反应过程中分子的分布情况呢？用lammps自带的命令能统计吗？
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1楼 2017-10-24 14:26:36
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wuhaigang

木虫 (著名写手)

奋斗的虫虫

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
第一，无论怎么样，你的同类元素都会产生不同的原子类型，而lammps是不会进行相应项的合并的，例如C1C5，不会产生C6这种结果，需要自己编程提取每个节点的分子片段。
第二，使用reax/pieces，或者类似的，产生时间点下的分子片段统计，详细看manual
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2楼2017-10-26 16:17:50
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