| 查看: 870 | 回复: 7 | ||
雪野千树新虫 (小有名气)
|
[求助]
gromacs可以做蛋白与蛋白质之间的分子动力学吗？
|
|
如题，我有两个106个残基组成的蛋白质，我对接后可以用gromacs来跑分子动力学吗？如果可以的话，和小分子与蛋白质之间的分子动力学有什么不同？ 发自小木虫IOS客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
评审有感
已经有12人回复
-
上海大学实验技术岗位非升即走
已经有9人回复
-
云南大学材料与能源学院解琳课题组钙钛矿博士招生
已经有4人回复
-
博士申请
已经有6人回复
-
面上本子正文33页，违规吗？会被低分嘛？
已经有10人回复
-
国自然上会要求
已经有9人回复
-
今年审到国自然15份，谈谈感受
已经有16人回复
-
考博自荐
已经有6人回复
-
青C资助名额大幅增加！
已经有16人回复
-
重磅！青年科学基金项目（C类）资助增幅预计超过50%
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
2楼2017-10-20 18:00:39
3楼2017-10-20 18:00:47
雪野千树
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1629.7
- 散金: 65
- 红花: 1
- 帖子: 276
- 在线: 59.9小时
- 虫号: 3989131
- 注册: 2015-07-24
- 专业: 理论环境化学
4楼2017-10-20 18:08:03
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
5楼2017-10-20 18:46:59
雪野千树
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1629.7
- 散金: 65
- 红花: 1
- 帖子: 276
- 在线: 59.9小时
- 虫号: 3989131
- 注册: 2015-07-24
- 专业: 理论环境化学
6楼2017-10-20 18:53:21
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
|
gmx做小分子需要自己添加小分子的力场参数，比较麻烦一点。粗糙一点可以用ambertools做，精细些可以先用高斯算、然后再用ambertools。得到的文件还要用acpype转成gmx格式，并手动修改一点，以便使用。 发自小木虫Android客户端 |
7楼2017-10-20 22:51:42
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
8楼2017-10-20 22:53:54
20