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谜雾xiaoxiao木虫 (小有名气)
环境微生物苦逼研究生
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[求助]
细菌16S通用引物为什么会扩增出叶绿体呢？ 已有2人参与
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| 在进行高通量测序的时候，使用了细菌的通用引物（338F 5'- ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3'和806R 5'- GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3'），为什么会扩增出叶绿体的序列呢？不是针对细菌的引物么？难道叶绿体的序列与细菌相似？ |
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4楼2017-10-30 15:12:01
jayven
铁杆木虫 (著名写手)
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2楼2017-10-13 13:09:03
3楼2017-10-26 11:16:30
【答案】应助回帖
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谜雾xiaoxiao: 金币+40, ★★★★★最佳答案 2018-01-12 14:54:34
谜雾xiaoxiao: 金币+40, ★★★★★最佳答案 2018-01-12 14:54:34
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植物的叶绿体中有4种rRNA(23S、16S、4.5S及5S），所以用16S的通用引物的话，可以将叶绿体的扩增出来。 其实不光叶绿体中有16S，线粒体中也有16S。 已经有文献进行了报道。 如果你的样本是叶片、茎部等含有叶绿体的样本，建议用特殊的引物，可以避开叶绿体。 你可以看一下相关文献。 A PCR-based toolbox for the culture-independent quantification of total bacterial abundances in plant environments |
5楼2017-12-04 10:17:44