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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 细菌16S通用引物为什么会扩增出叶绿体呢？
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谜雾xiaoxiao

木虫 (小有名气)

环境微生物苦逼研究生

[求助] 细菌16S通用引物为什么会扩增出叶绿体呢？ 已有2人参与

在进行高通量测序的时候，使用了细菌的通用引物（338F        5'- ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3'和806R        5'- GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3'），为什么会扩增出叶绿体的序列呢？不是针对细菌的引物么？难道叶绿体的序列与细菌相似？
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1楼 2017-10-13 09:42:20
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jayven

铁杆木虫 (著名写手)
比如蓝细菌

发自小木虫Android客户端
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2楼2017-10-13 13:09:03
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teamo032501

新虫 (初入文坛)
亲，你解决了嘛，有同样的问题TT
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3楼2017-10-26 11:16:30
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二十一业

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

细菌的16SrRNA通用引物是有可能扩出来动物或者植物的核糖体RNA的，所以这不是啥稀罕事
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4楼2017-10-30 15:12:01
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小马科研部落

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
谜雾xiaoxiao: 金币+40, ★★★★★最佳答案 2018-01-12 14:54:34
植物的叶绿体中有4种rRNA(23S、16S、4.5S及5S），所以用16S的通用引物的话，可以将叶绿体的扩增出来。
其实不光叶绿体中有16S，线粒体中也有16S。
已经有文献进行了报道。
如果你的样本是叶片、茎部等含有叶绿体的样本，建议用特殊的引物，可以避开叶绿体。
你可以看一下相关文献。
A PCR-based toolbox for the culture-independent quantification of total bacterial
abundances in plant environments
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更多内容，请关注微信公众号【小马科研部落】，有问题可找QQ308091253
5楼2017-12-04 10:17:44
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