24小时热门版块排行榜    

查看: 1055  |  回复: 7
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

sophy8069

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】counterpoise中遇到的问题

我的分子体系是用DFT/B3LYP优化的,对不同的原子用的不同的基组,计算出来的能量还要BSSE吗??用counterpoise后的输出文件中有很多行counterpoise:corrected energy=...........counterpoise:BSSE energy=...........那么在计算键能时应该用哪一行的修正呢?并且问下是E=E(AB)-E(A)-E(B)+corrected energy 还是E=E(AB)-E(A)-E(B)+BSSE energy呢????
请各位给小女子指点一下,多谢了!!!

[ Last edited by xuefei06 on 2009-2-21 at 23:17 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高斯

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuhuobuku

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
jghe(金币+3,VIP+0):感谢你参与讨论 2-19 20:24
gwdavid(金币+3,VIP+0):这种原创答案只是辛苦费也值6金币了! 2-21 21:43
举个例子,比如计算AB体系的BSSE矫正:
需要得出的五个能量分别是:
第一个是整体的能量E(AB)
第二个是单独计算A的能量E(A)
第三个是单独计算B的能量E(B)
第四个是计算在AB基组下,A的能量E(A/AB)
第五个是计算在AB基组下,B的能量E(B/AB)

那么,BSSE energy =E(A)+E(B)-E(A/AB)-E(B/AB)。计算E(A/AB)的基函数是计算AB的基函数,而计算E(A)的基函数只是计算AB基函数的一部分,基函数越多,能量计算的越准确,能量计算越准确,就越低,所以E(A/AB) 所以经过矫正的结合能由于加上了一个BSSE energy,并且这个值是大于零的,所以矫正后的结合能要比没矫正前的结合能大。

输出文件里面5个scf第一个是整体的能量(记为E(AB)),后面4个是单体能量,分别是2个部分在整体基组和各自基组下的能量。

我当时是用-Bq原子算的BSSE矫正, 估计你是用CP方法吧。但原理都是一样的。

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1099266
薄酒可以忘忧,丑妻可以白头,徐行不必驷马,称身不必狐裘平淡才是生活的主旋律
7楼2009-02-19 15:22:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

jghe

金虫 (著名写手)

★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):thanks! 2-18 23:31
要用这个公式E=E(AB)-E(A)-E(B) 就要考虑BSSE校正了,一般如果不是若相互作体系不用考虑
输出文件中第一个是总能量,第二个是Part1(校正过)的,第三个是Part2(校正过)的 ,第四个是Part1(未校正过)的,第五个是Part2(未校正过)的。
自己把能量列出来,比一比就知道了
2楼2009-02-18 20:24:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sophy8069

银虫 (小有名气)

你说的是没用counterpoise时的输出文件还是用了的啊??再有我用counterpoise算得的输出文件中有好多行counterpoise输出结果,我不知道用哪一次的,是不是用最后收敛前的counterpoise????
3楼2009-02-18 21:20:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sophy8069

银虫 (小有名气)

请问在counterpoise输出文件从哪可以找到最终的BSSE energy的值啊???哪个好心人给解答一下啊!!!
4楼2009-02-18 21:37:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +3 启萌科技 2026-08-12 10/500 2026-08-13 20:42 by hmhminy
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +9 Tide man 2026-08-10 10/500 2026-08-13 20:33 by 温淼淼淼
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 28/1400 2026-08-13 17:51 by 医学老男孩
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +4 majunge000 2026-08-11 6/300 2026-08-13 16:50 by 四季常青藤
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
请填处理意见