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sophy8069

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】counterpoise中遇到的问题

我的分子体系是用DFT/B3LYP优化的,对不同的原子用的不同的基组,计算出来的能量还要BSSE吗??用counterpoise后的输出文件中有很多行counterpoise:corrected energy=...........counterpoise:BSSE energy=...........那么在计算键能时应该用哪一行的修正呢?并且问下是E=E(AB)-E(A)-E(B)+corrected energy 还是E=E(AB)-E(A)-E(B)+BSSE energy呢????
请各位给小女子指点一下,多谢了!!!

[ Last edited by xuefei06 on 2009-2-21 at 23:17 ]
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jghe

金虫 (著名写手)

★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):thanks! 2-18 23:31
要用这个公式E=E(AB)-E(A)-E(B) 就要考虑BSSE校正了,一般如果不是若相互作体系不用考虑
输出文件中第一个是总能量,第二个是Part1(校正过)的,第三个是Part2(校正过)的 ,第四个是Part1(未校正过)的,第五个是Part2(未校正过)的。
自己把能量列出来,比一比就知道了
2楼2009-02-18 20:24:07
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sophy8069

银虫 (小有名气)

你说的是没用counterpoise时的输出文件还是用了的啊??再有我用counterpoise算得的输出文件中有好多行counterpoise输出结果,我不知道用哪一次的,是不是用最后收敛前的counterpoise????
3楼2009-02-18 21:20:30
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sophy8069

银虫 (小有名气)

请问在counterpoise输出文件从哪可以找到最终的BSSE energy的值啊???哪个好心人给解答一下啊!!!
4楼2009-02-18 21:37:54
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xuhu_11

金虫 (职业作家)


jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论 2-19 20:22
使用了counterpoise后 在最后面很容易看到Counterpoise: BSSE energy =     ***呀
千万别考博!
5楼2009-02-19 09:18:01
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sophy8069

银虫 (小有名气)

哦   因为有很多行BSSE energy 的输出值,所以刚开始我不知道选哪一行的。谢谢指点了!
6楼2009-02-19 11:04:58
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yuhuobuku

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
jghe(金币+3,VIP+0):感谢你参与讨论 2-19 20:24
gwdavid(金币+3,VIP+0):这种原创答案只是辛苦费也值6金币了! 2-21 21:43
举个例子,比如计算AB体系的BSSE矫正:
需要得出的五个能量分别是:
第一个是整体的能量E(AB)
第二个是单独计算A的能量E(A)
第三个是单独计算B的能量E(B)
第四个是计算在AB基组下,A的能量E(A/AB)
第五个是计算在AB基组下,B的能量E(B/AB)

那么,BSSE energy =E(A)+E(B)-E(A/AB)-E(B/AB)。计算E(A/AB)的基函数是计算AB的基函数,而计算E(A)的基函数只是计算AB基函数的一部分,基函数越多,能量计算的越准确,能量计算越准确,就越低,所以E(A/AB) 所以经过矫正的结合能由于加上了一个BSSE energy,并且这个值是大于零的,所以矫正后的结合能要比没矫正前的结合能大。

输出文件里面5个scf第一个是整体的能量(记为E(AB)),后面4个是单体能量,分别是2个部分在整体基组和各自基组下的能量。

我当时是用-Bq原子算的BSSE矫正, 估计你是用CP方法吧。但原理都是一样的。

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1099266
薄酒可以忘忧,丑妻可以白头,徐行不必驷马,称身不必狐裘平淡才是生活的主旋律
7楼2009-02-19 15:22:19
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sophy8069

银虫 (小有名气)

可我得到的
SCF Done:  E(RB+HF-LYP) = -0.927037093185     A.U. after    5 cycles
             Convg  =    0.5768D-06             -V/T =  2.0727
             S**2   =   0.0000
Cartesian Forces:  Max     0.016383271 RMS     0.005381735
Counterpoise: corrected energy =    -929.170121753971
Counterpoise: BSSE energy =       0.008432377925
不只5个啊  这样的输出有好多个啊   我选的就是最后的一个,也就是
Maximum Force            0.000372     0.000450     YES
RMS     Force            0.000131     0.000300     YES
Maximum Displacement     0.001575     0.001800     YES
RMS     Displacement     0.000648     0.001200     YES
这个上面的输出
8楼2009-02-21 15:45:33
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