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suqitong铜虫 (初入文坛)
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α-酮戊二酸与5mc的反应 已有1人参与
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| α-酮戊二酸与5mc的反应所涉及其他底物，反应的产物（除了5hmc之外）都有什么，反应的机理是什么（化学上的机理），该反应中，TET酶是怎么起作用的？ |
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【答案】应助回帖
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TET（Ten-eleven translocation）蛋白家族共有3个成员，分别为TET1、TET2和TET3，均属于α-酮戊二酸（α-KG）和Fe2＋依赖的双加氧酶，可以将5-甲基胞嘧啶（5-methylcytosine,5 mC）氧化为5-羟甲基胞嘧啶（5-hydroxymethylcytosine,5 hmC）、5-甲酰基胞嘧啶（5-formylcytosine,5 fC）及5-羧基胞嘧啶（5-carboxylcytosine,5 caC）。研究表明，TET蛋白通过不同机制以主动或被动的方式调控DNA去甲基化，且去甲基化的活性可能受其他因子的调控。TET蛋白广泛参与哺乳动物发育过程的调节，其中在原始生殖细胞的形成、胚胎发育、干细胞多能性及神经和脑发育等方面发挥了重要作用。TET蛋白生物功能的发现为表观遗传学研究开辟了全新的研究领域，而且相关研究结果对拓展生命科学研究具有重要意义。 具体可以参考文献：TET蛋白的去甲基化机制及其在调控小鼠发育过程中的作用。 |
2楼2017-10-06 15:42:23
suqitong
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TET蛋白对5mC具备很高活性(产生5hmC)，而对5hmC(产生5fC)和5fC(产生5caC)的活性很低。TET蛋白就如同连续的三个扶梯，在转化不同碱基的情况下，其转化速度明显不同，导致产生较多的5hmC和少量的5fC及5caC 。结构研究发现，5mC在TET蛋白催化口袋中的取向使得它很容易被催化活性中心俘获并被氧化为5hmC。5hmC和5fC由于已经有氧的存在，其在催化口袋中被限制住，不容易发生进一步的氧化反应，导致TET蛋白对这两种碱基活性降低。在这样的催化能力差异下，TET会很顺利将5mC产生5hmC，一旦5hmC产生，TET将不容易使其进一步氧化为5fC和5caC，导致细胞内5hmC相对稳定，并且其含量远远高于5fC和5caC。在特定的基因中区域，TET蛋白可能被特定的调控因子激活，会跨越能垒阻碍产生高活性的TET，连续氧化为5fC和5caC。这使得5mC在TET蛋白催化下更容易被氧化为5hmC。 |
4楼2017-10-06 16:17:12
suqitong
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5楼2017-10-06 16:56:07
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