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yangdongjiao

新虫 (小有名气)

[求助] MS导入Lammps原子跑偏问题

求助:用MS建模,本来在下面的原子经过导入Lammps后跑到了上面,这个是什么原因?该怎么解决呢?

MS导入Lammps原子跑偏问题
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MS导入Lammps原子跑偏问题-1
8SQ$LZL`P6$B@)F91HC~J4D.png
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风云1996

新虫 (小有名气)

我说的可能不准确,是minimum image convention。这个可以参考樊老师的博文http://wap.sciencenet.cn/blogview.aspx?id=968600。我没看懂你说说的问题是什么意思,周期性边界不就应该下进上出吗?你要是很在意可以扩大盒子啊。应该不会出现上面的情况。但是实际上我觉得没啥影响。

发自小木虫Android客户端
7楼2017-10-09 12:23:52
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lywal

银虫 (小有名气)

2楼2017-10-05 18:04:25
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yangdongjiao

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lywal at 2017-10-05 18:04:25
周期性边界吧

谢谢回答。那怎么修改能够恢复的原来的样子?因为这样会影响后续的操作,修改data文件吗?
3楼2017-10-06 10:08:24
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风云1996

新虫 (小有名气)

边界问题,周期性我觉得没啥影响,在计算时候采用最小镜像法,应该没问题

发自小木虫Android客户端
4楼2017-10-07 16:04:39
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