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2009103158

新虫 (著名写手)

[交流] 定量PCR引物溶解曲线问题

我做定量PCR在一板96孔板中试了43对引物,想看下引物的溶解曲线情况。
问题:1,扩增的结果表明(见附图1)各引物除了在91度之前有一个正向峰外,又都在94度附近有一个反向峰,并且大部分引物的反向峰比正向峰还要峰值绝对值要搞,请问这是为什么?
          2,根据引物的溶解曲线该如何衡量和判定引物可不可用?有没有对溶解温度(有没有合适的范围?有些引物溶解温度达到了90度),峰型(高度,坡度等)等细化的指标来判断,见附图2。
          3,在刚开始温度递增的前期阶段,部分引物会有一个凹陷,请问是为什么?见附图3
          4,对每个引物分别用稀释2倍和稀释8倍后的模板进行扩增,结果发现部分引物两次扩增的溶解温度之间有一定的偏差,这是为什么?见附图4
请教大虾指教!谢谢!!!

定量PCR引物溶解曲线问题
附图1.jpg


定量PCR引物溶解曲线问题-1
附图2.jpg


定量PCR引物溶解曲线问题-2
附图3.jpg


定量PCR引物溶解曲线问题-3
附图4.jpg
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wrxnyd54

木虫 (著名写手)


★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
2009103158: 金币+1, 谢谢! 2017-10-04 15:39:23
帮你顶,人还是厚道点好
2楼2017-10-04 01:42:53
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山还在那儿

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
染料法?

一般染料法溶解曲线只有一个峰算是扩增产物专一,若标准曲线测试良好,则可用!

你的情况,我需要看一下原始的溶解曲线,即“Z”型溶解曲线,才能判断!
3楼2017-10-09 09:35:15
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zoeyang_96

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我发现可能是仪器的问题,旧的7500就会出现这样的曲线。新的不会
4楼2021-05-21 12:38:02
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