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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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雪野千树

新虫 (小有名气)

[交流] sybyl对接后蛋白质里的小分子怎么提出来 已有1人参与

sybyl对接时,蛋白质pdb文件里原来就有一个小分子cofactor,怎样才可以把它提出来存为mol2文件?

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雪野千树

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by JIANGWENJUN at 2017-10-06 15:13:25
你说的小分子是蛋白质的配体??提取出来后转mol2格式

是的,那个蛋白质的pdb文件里本来就包含一个小分子配体,我想把它提出来做mol2文件

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3楼2017-10-06 17:05:37
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JIANGWENJUN

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你说的小分子是蛋白质的配体??提取出来后转mol2格式

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2楼2017-10-06 15:13:25
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JIANGWENJUN

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 雪野千树 at 2017-10-06 17:05:37
是的,那个蛋白质的pdb文件里本来就包含一个小分子配体,我想把它提出来做mol2文件
...

这时候要转格式,转mol2,过程怎么说呢?也不麻烦

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4楼2017-10-07 17:56:27
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雪野千树

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by JIANGWENJUN at 2017-10-07 17:56:27
这时候要转格式,转mol2,过程怎么说呢?也不麻烦
...

能详细讲一下吗?

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5楼2017-10-07 17:57:35
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