| 查看: 1690 | 回复: 3 | |||
mastermix新虫 (初入文坛)
|
[交流]
启动子区域问题，求大神解答！ 已有2人参与
|
我先说一下我是怎么找，然后求大神指点！我在NCBI上找到了基因的序列，序列给出了TATAbox和5'UTR位置（疑问是为啥它给出两段5'UTR序列，两段间距离大概有2kb，并且第二段5UTR序列紧挨着ATG）我以第一段5'UTR也就是挨着TATAbox的那段为转录起始点，取-2000bp~+250bp(promoter server 2.0预测这段的可能性比较大)为启动子区域做转录因子预测时结果不如意，转录因子结合可能性都比较小，然后，我把ATG上游4000bp做CPG岛预测时，反而在第二个5UTR区域，也就是ATG上游附近的400bp预测出了CPG岛？！然后我观察发现第一段和第二段UTR之间的这2000bp序列很大一部分都是repeat region ，也就是散在重复序列，我已经凌乱了，到底哪些是启动子区域啊！（图中蓝色为给出的5'UTR,粉色为CDs序列，起始为ATG） 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
化工申博
已经有3人回复
-
申博自荐
已经有3人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有191人回复
-
广西民族大学化学化工学院化学工程与技术学硕，材料化工专硕调剂名额充足！
已经有0人回复
-
透明质酸酶的作用机制：如何实现药物递送
已经有0人回复
-
爱思维尔旗下LWT投稿
已经有9人回复
-
替拉扎明为缺氧选择性细胞毒药物研究提供新思路
已经有0人回复
-
拉坦前列腺素(Latanoprost)：前列腺素F2α衍生物如何成为青光眼一线用药
已经有0人回复
-
卟啉家族中的明星分子：MESO-四(3,5-二溴-4-羟基苯基)卟啉的性质与制备
已经有1人回复
-
宠物寄生虫防治：氟雷拉纳阻断GABA受体，持效12周驱杀跳蚤蜱虫
已经有0人回复
-
为呼吸打开通道：依伐卡托的科学之旅
已经有0人回复
渊博震天
版主 (职业作家)
Yeast Display
- MolEPI: 7
- 应助: 212 (大学生)
- 贵宾: 0.043
- 金币: 22006.2
- 散金: 257
- 红花: 55
- 沙发: 1
- 帖子: 4581
- 在线: 688.8小时
- 虫号: 2380836
- 注册: 2013-03-27
- 性别: GG
- 专业: 抗体工程学
- 管辖: 分子生物
2楼2017-10-01 15:36:32
mastermix
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 195.8
- 帖子: 26
- 在线: 10.7小时
- 虫号: 5771483
- 注册: 2017-02-27
- 性别: GG
- 专业: 基础兽医学
3楼2017-10-01 17:49:00
4楼2018-08-05 15:35:31