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求助微生物基因分型的问题
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已经通过鉴定确定了菌株,但不确定到底属于哪个种属,请问谁知道哪个公司可以鉴定?![]() ![]() |
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suyouzhen
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这种情况常见,大多数人扩的都是16s部分片段,拿不到全长16s,拼装得到那几百个bp不足以提供种鉴定的信息。所以往往会加测16s23s间隔区,或者加测核糖体蛋白基因,或者保守的看家基因,然后做个多位点片段的串联再分析。这跟有没有核糖体数据库没关系,生物公司用的也是公共数据库。 发自小木虫Android客户端 |
6楼2017-09-26 14:47:35
云中鸿鹄
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2楼2017-09-25 16:05:52
suyouzhen
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细菌测16s核糖体通用引物PCR扩增子,Sanger一代双向测序,拼装reads,数据库比对,建立个进化树看聚到那一类群,鉴定到种的水平一般没问题。这种常规套路自己就能做,烂大街的技术了,交给那些生物公司猫腻太多净坑钱。 发自小木虫Android客户端 |
3楼2017-09-25 16:29:25
4楼2017-09-26 08:41:51











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