| 查看: 632 | 回复: 5 | ||
[求助]
求助微生物基因分型的问题
|
已经通过鉴定确定了菌株，但不确定到底属于哪个种属，请问谁知道哪个公司可以鉴定？ |
回复此楼» 猜你喜欢
311求调剂
已经有4人回复
-
304求调剂
已经有4人回复
-
354求调剂
已经有7人回复
-
321求调剂
已经有3人回复
-
274求调剂
已经有5人回复
-
281求调剂（0805）
已经有15人回复
-
085600材料与化工调剂 324分
已经有8人回复
-
能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名
已经有10人回复
-
267一志愿南京工业大学0817化工求调剂
已经有8人回复
-
328求调剂，英语六级551，有科研经历
已经有10人回复
云中鸿鹄
金虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 16567.1
- 散金: 20
- 红花: 7
- 帖子: 2014
- 在线: 246.5小时
- 虫号: 2447885
- 注册: 2013-05-04
- 性别: GG
- 专业: 天然药物化学
2楼2017-09-25 16:05:52
suyouzhen
铁杆木虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 6314.1
- 散金: 638
- 红花: 3
- 帖子: 226
- 在线: 148.3小时
- 虫号: 1859678
- 注册: 2012-06-14
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
|
细菌测16s核糖体通用引物PCR扩增子，Sanger一代双向测序，拼装reads,数据库比对，建立个进化树看聚到那一类群，鉴定到种的水平一般没问题。这种常规套路自己就能做，烂大街的技术了，交给那些生物公司猫腻太多净坑钱。 发自小木虫Android客户端 |
3楼2017-09-25 16:29:25
4楼2017-09-26 08:41:51
5楼2017-09-26 08:57:09
suyouzhen
铁杆木虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 6314.1
- 散金: 638
- 红花: 3
- 帖子: 226
- 在线: 148.3小时
- 虫号: 1859678
- 注册: 2012-06-14
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
|
这种情况常见，大多数人扩的都是16s部分片段，拿不到全长16s，拼装得到那几百个bp不足以提供种鉴定的信息。所以往往会加测16s23s间隔区，或者加测核糖体蛋白基因，或者保守的看家基因，然后做个多位点片段的串联再分析。这跟有没有核糖体数据库没关系，生物公司用的也是公共数据库。 发自小木虫Android客户端 |
6楼2017-09-26 14:47:35
