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如何分析auto dock的对接结果 已有2人参与
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小白一枚，刚接触模拟。 我用autodock对接了一个蛋白质和一个小分子，想知道蛋白质上哪几个残基对两者的结合作用很重要，如何分析对接的结果。 具体有以下几个问题： 1.需要分析两者之间的哪些作用才能找到关键残基？ 2.如何用DS或者auto dock分析配体受体之间的疏水相互作用？ 3.如何用DS或者auto dock分析配体受体之间的静电匹配？ |
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【答案】应助回帖
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文吃鱼奔奔: 金币+2, ★有帮助 2017-09-25 20:31:41
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文吃鱼奔奔: 金币+2, ★有帮助 2017-09-25 20:31:41
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很多软件都不显示疏水作用的，这可能是因为疏水作用不大好显示。 可以自己根据经验判断，也可以用poseview试试，有在线服务，绿色曲线即表示疏水作用。 发自小木虫Android客户端 |
5楼2017-09-24 15:33:01
6楼2020-07-24 11:09:04
7楼2020-08-15 09:35:34