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铜锤玉带草

金虫 (著名写手)

[求助] 晶体数据中键长键角后面括号里的数字代表什么 已有3人参与

如下图,键长1.316(17)指的是1.316-0.17,1.316+0.17么?键长2.33(20)(A )指的是长度为2.33-0.20到2.33+0.20(A )么?为什么小数点后数字位数不一样呢?

晶体数据中键长键角后面括号里的数字代表什么
搜狗截图17年09月22日1057_1.png
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专注药物合成一百年
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专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
铜锤玉带草: 金币+10, 有帮助 2017-09-23 00:41:48
引用回帖:
3楼: Originally posted by 铜锤玉带草 at 2017-09-22 18:03:17
先谢谢啦!括号里的数字就是指的是括号前数字的最后几位?那么,这个键长键角小数点后保留位数为嘛不一样呢?这个是有特别的要求还是任意保留的?...

这是程序计算出来的数值

发自小木虫Android客户端
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
5楼2017-09-22 23:57:16
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普通回帖

匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信


感谢参与,应助指数 +1
本帖仅楼主可见
2楼2017-09-22 12:59:28
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铜锤玉带草

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lich666 at 2017-09-22 12:59:28
后面是误差,1.316(20)相当于1.316+-0.020

先谢谢啦!括号里的数字就是指的是括号前数字的最后几位?那么,这个键长键角小数点后保留位数为嘛不一样呢?这个是有特别的要求还是任意保留的?
专注药物合成一百年
3楼2017-09-22 18:03:17
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DJ_Tokyo

新虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 铜锤玉带草 at 2017-09-22 18:03:17
先谢谢啦!括号里的数字就是指的是括号前数字的最后几位?那么,这个键长键角小数点后保留位数为嘛不一样呢?这个是有特别的要求还是任意保留的?...

貌似要小于10是比较好的,之前听上海有机所的一位老师讲,他们组里的晶体如果括号里大于10,他会让他的学生重新培养晶体再测。
4楼2017-09-22 22:49:21
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oyljw

至尊木虫 (职业作家)

格物致知Professional

可能是estimated standard deviations (ESDs)值吧
独立之精神自由之思想
6楼2020-11-24 14:09:02
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oyljw

至尊木虫 (职业作家)

格物致知Professional

Mercury软件显示后面的值和那个差不太多  
那个里面这样说的:

Why does Mercury not generate an ESD for a particular bond length, angle, torsion or other measurement in my structure?
Solution

Mercury provides the tabulation of measured and standard molecular geometric parameters, along with estimated standard deviations (ESDs) for those values, in various tabs of the More Info dialogue box (such as Bonds, Distances and All Angles). The calculation of ESDs for any of these measurements within crystal structures relies on the underlying atomic coordinates having associated ESDs. Mercury will only calculate an ESD for a measurement if ALL the associated atoms have full atomic coordinate ESDs.

An example where this is highly relevant is a standard organic crystal structure where the atomic coordinates of the non-hydrogen atoms within the model have been freely refined, but the hydrogens have been placed at geometric positions and either set to be ‘fixed’ or ‘riding’. In this example the non-hydrogen atomic coordinates would have ESDs, but the hydrogen positions would not. Mercury will tabulate the measured values of all bond lengths, angles and torsions, but those geometric parameters involving hydrogen will not have ESDs as they would not make any sense scientifically – essentially those parameters have been fixed, not refined.

但我也不太确定。
独立之精神自由之思想
7楼2020-11-24 14:10:56
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