应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】请教关于用PBS提交DMOl3作业的问题
41/1返回列表
查看: 641  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 he23981006 的 5 个金币

he23981006

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教关于用PBS提交DMOl3作业的问题

向各位虫友请教一个问题:
      DMOl3在集群下装好后,直接在命令行提交是可以进行计算的,并串行都可以,但有个问题是不能排队. 因此尝试用pbs脚本提交作业,总是不能成功,而同样的脚本对CASTEP却没有问题.脚本如下:
mpirun -np 14 -machinefile $PBS_NODEFILE /public/home/user/ms3.0/CASTEP/bin/castepexe_mpi.exe CrBN222pf,

将"castepexe_mpi.exe "换成"dmol3_mpi.exe"进行计算时总是出错.不知大家的脚本是怎样写的,在此请教大家一下.

[ Last edited by he23981006 on 2009-2-14 at 10:09 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-02-14 10:04:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dlyao

你是高手，高手的帖子一定要顶的。不过怎么还用ms3.0？
这个帖子对我很有用，正在寻找怎么使用mpi呢，多谢。
不过请问，这个$PBS_NODEFILE对应到LSF是什么？我们这里的排队系统是LSF。
赞一下 回复此楼
2楼2009-02-17 02:22:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dlyao

是我菜了，这个$PBS_NODEFILE其实就是一个计算节点的列表对应的文件而已。我知道了。不过4.3下一执行阿，还是很多错误。不过我先试的dmol，没有试castep，等下空了试试看castep。
赞一下 回复此楼
3楼2009-02-17 08:39:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

he23981006

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by dlyao at 2009-2-17 08:39:
是我菜了，这个$PBS_NODEFILE其实就是一个计算节点的列表对应的文件而已。我知道了。不过4.3下一执行阿，还是很多错误。不过我先试的dmol，没有试castep，等下空了试试看castep。

呵呵，好的，但愿你早点调成功！
赞一下 回复此楼
4楼2009-02-17 12:20:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 he23981006 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-15 14:25 by VMDqgnlKimtZ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:14 by VMDqgnlKimtZ
[基金申请] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 3/150 2026-09-15 10:02 by VMDqgnlKimtZ
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:58 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:26 by C79jjtjAKjEn
[考博] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 07:58 by C79jjtjAKjEn
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 6/300 2026-09-15 07:38 by C79jjtjAKjEn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:26 by C79jjtjAKjEn
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 6/300 2026-09-15 07:14 by C79jjtjAKjEn
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:01 by 5BDX0d0WFp7t
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:38 by 5BDX0d0WFp7t
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:38 by 5BDX0d0WFp7t
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-15 05:34 by 5BDX0d0WFp7t
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 3/150 2026-09-15 05:26 by 5BDX0d0WFp7t
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:45 by vZfe6xYu34yj
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 6/300 2026-09-14 22:37 by vZfe6xYu34yj
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +4 两三岁ss 2026-09-14 4/200 2026-09-14 20:29 by 班主任的同桌
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-14 17:48 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭