| 查看: 785 | 回复: 0 | ||
[求助]
opls-aa力场文件计算的torsion问题
|
|
如题，由于找不到Tinker，就发到Gromacs了，但是调用的力场都是opls-aa，恳请大神指教 用Tinker调用opls-aa力场计算苯甲醇，苯环的C,H选 atom 90 48 CA "Aromatic C" 6 12.011 3 charge -0.1150 atom 91 49 HA "Aromatic H-C" 1 1.008 1 charge +0.1150 CH2OH的OH选 atom 96 5 OH "Alcohol -OH" 8 15.999 2 charge -0.6830 atom 97 7 HO "Alcohol -OH" 1 1.008 1 charge +0.4180 CH2的H选 atom 85 46 HC "Alkane H-C" 1 1.008 1 charge +0.060 CH2OH中的CH2的C应该选160吧看环境，但是总电荷不为0，选161就等于0 atom 160 13 CT "Benzyl Alcohol -CH2OH" 6 12.011 4 charge +0.200 atom 161 13 CT "Benzyl Alcohol -CHROH" 6 12.011 4 charge +0.260 不知道该怎么选？ 还有个问题，不论选160还是161，都提示无法计算，缺少torsion Undefined Torsional Parameters : Type Atom Names Atom Classes Torsion 3-CA 4-CA 12-CT 15-OH 48 48 13 5 Torsion 5-CA 4-CA 12-CT 15-OH 48 48 13 5 MECHANIC -- Some Required Potential Energy Parameters are Undefined TINKER is Unable to Continue; Terminating the Current Calculation 请问这个torsion数据可以在哪里找？难道这么简单的苯甲醇opls-aa都不能算吗？新手求教了 谢谢了  |
回复此楼» 猜你喜欢
面上项目申报
已经有3人回复
-
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有5人回复
-
酰胺脱乙酰基
已经有9人回复
-
CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生｜MSCA经费充足、排名优
已经有5人回复
-
有70后还继续奋斗在职场上的吗？
已经有6人回复
-
博士延得我，科研能力直往上蹿
已经有7人回复
-
退学或坚持读
已经有27人回复
-
面上基金申报没有其他的参与者成吗
已经有5人回复
-
遇见不省心的家人很难过
已经有22人回复