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ilovecats木虫 (正式写手)
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NCBI比对显示，和好几个菌株（同一种）都是E-value 0.0, ident 99% 已有1人参与
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请教各位专家， 我从样品中分离出一个菌株进行了鉴定，NCBI比对显示，和好几个菌株（同一种）都是E-value 0.0, ident为99%.请问： 1.比对结果的第一个是不能培养的菌？那我分离出的菌株是不是不可以写第一个结果？ 2.后面几个结果都是Bacillus thermoamylovorans 下的不同菌株，且它们的E值、identity、query coverage等值都一样。那我分离的到底是结果中的哪一种？ 3.结果第2条：Bacillus thermoamylovorans strain Amp-choc19是这个菌株的名字吧，其中的“Amp-choc”是什么意思？为什么和其他的菌株命名方式不一样？ 谢谢专家们！  B4.jpg |
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ilovecats
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3楼2017-08-26 21:04:53
首先你的目的是鉴定你分离的菌株，结果很明确是Bacillus thermoamylovorans ，你的目的达到了。至于这些序列菌名后的符号，都是对菌株的具体描述，对你鉴定帮助不大，不过你也可以将你的序列投递到Genbank，然后给你的菌株起个名字 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2017-08-26 15:09:56
【答案】应助回帖
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ilovecats: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2017-08-27 14:10:06
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ilovecats: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2017-08-27 14:10:06
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我一般都会将测序得到的序列投递到Genbank中，得到一个你截屏中独特的accession号，写文章时会用到这个号。至于菌株号，其实是在投递序列时自己给的，没什么神秘的。 发自小木虫IOS客户端 |
4楼2017-08-26 21:20:10
ilovecats
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5楼2017-08-27 14:12:04