| 查看: 1794 | 回复: 5 | ||
ilovecats木虫 (正式写手)
|
[求助]
NCBI比对显示，和好几个菌株（同一种）都是E-value 0.0, ident 99% 已有1人参与
|
|
请教各位专家， 我从样品中分离出一个菌株进行了鉴定，NCBI比对显示，和好几个菌株（同一种）都是E-value 0.0, ident为99%.请问： 1.比对结果的第一个是不能培养的菌？那我分离出的菌株是不是不可以写第一个结果？ 2.后面几个结果都是Bacillus thermoamylovorans 下的不同菌株，且它们的E值、identity、query coverage等值都一样。那我分离的到底是结果中的哪一种？ 3.结果第2条：Bacillus thermoamylovorans strain Amp-choc19是这个菌株的名字吧，其中的“Amp-choc”是什么意思？为什么和其他的菌株命名方式不一样？ 谢谢专家们！  B4.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
293调剂
已经有3人回复
-
机械工程264学硕求调剂
已经有3人回复
-
264求调剂
已经有9人回复
-
求调剂
已经有6人回复
-
22408 266求调剂
已经有7人回复
-
求调剂
已经有14人回复
-
273求调剂
已经有43人回复
-
307求调剂
已经有13人回复
-
327求调剂
已经有7人回复
-
338求调剂
已经有6人回复
首先你的目的是鉴定你分离的菌株，结果很明确是Bacillus thermoamylovorans ，你的目的达到了。至于这些序列菌名后的符号，都是对菌株的具体描述，对你鉴定帮助不大，不过你也可以将你的序列投递到Genbank，然后给你的菌株起个名字 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2017-08-26 15:09:56
ilovecats
木虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 4561.2
- 散金: 139
- 红花: 1
- 帖子: 420
- 在线: 75小时
- 虫号: 886824
- 注册: 2009-10-28
- 性别: MM
- 专业: 环境工程
3楼2017-08-26 21:04:53
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
ilovecats: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2017-08-27 14:10:06
感谢参与，应助指数 +1
ilovecats: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2017-08-27 14:10:06
|
我一般都会将测序得到的序列投递到Genbank中，得到一个你截屏中独特的accession号，写文章时会用到这个号。至于菌株号，其实是在投递序列时自己给的，没什么神秘的。 发自小木虫IOS客户端 |
4楼2017-08-26 21:20:10
ilovecats
木虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 4561.2
- 散金: 139
- 红花: 1
- 帖子: 420
- 在线: 75小时
- 虫号: 886824
- 注册: 2009-10-28
- 性别: MM
- 专业: 环境工程
5楼2017-08-27 14:12:04
6楼2017-08-27 14:54:14
