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赵敏9565

铁虫 (小有名气)

[交流] 转学生物信息,如何?已有1人参与

请教个问题,以前做分子生物学,取得了博士学位,现在已经30多岁,也用分子生物学的知识,申请得到了国基,但现在想转方向,学习生物信息学,原因呢,1.不喜欢做实验;2.现在单位条件差,做实验很难取得好结果。所以想,改成生物信息学,就不用在意学校的硬件条件了,不知道这样的想法,是否合理?

此外,应该从何处开始?难度有多大?我自己想从统计学和VB开始,如何?
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fraser

银虫 (正式写手)


司马诸葛(金币+1,VIP+0):谢谢交流 8-31 14:27
我实验室 有一个小老板是做生物信息的,天天搞模拟,搞数据库,经常就是泡在电脑面前搞代码和测试,去年发了一篇6的文章。如果想搞科研,考虑还是去好的学校和研究所。另外,搞生物信息还要看你的资源,那个小老板和我们学校化学院的人合作才开始顺利的,楼主三思。
2楼2009-02-11 08:07:10
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phyco

铜虫 (小有名气)

★ ★
司马诸葛(金币+2,VIP+0):谢谢交流 8-31 14:28
几年没有上来了,今天上来就回了你的帖子啊:)
我是做生物信息的,做了也有五六年了,也算有些经验。
看你的情况,想半路出家转生物信息,其实在生物领域换任何方向难度都差不多,只要努力总能克服。
生物信息领域很广泛,简简单单的“搞模拟,搞数据库。。。泡在电脑面前搞代码和测试”已经发不了好的paper了(NAR数据库类的除外,尽管只是IF高一些,含金量并不高),所以最好是结合你自己的背景,根据实际需求来选择方向。
统计在生物信息学领域有很多应用,但是学了统计并非就是进入了bioinformatics。生物信息学就是bio + informatics,所有in silico的工作都可以归进去。所以要学会编程,学会处理大规模数据,学会从整体(基因组)的角度来思考问题。
VB虽然学起来容易,但在bioinformtics中应用不大,建议可以学perl, python, java。以上语言学通一门就可以应付所有常见编程工作了。
总之一句话,想尽快入门,不是看基本入门书(老是看书,永远也入不了门),而是根据实际工作需求,有目的的用信息手段去做。

[ Last edited by phyco on 2009-2-11 at 10:30 ]
3楼2009-02-11 10:28:37
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赵敏9565

铁虫 (小有名气)

谢谢三楼的建议,其实我已经看了基本所为生物信息学的书,感觉还是没入门。其实,我想转,也是没办法,现在的领域,我自己做的还算顺利,也已经有了课题,有了自己的研究生,可是我们学校硬件太差,在这里想作出SCI真的太难了,我就想,如果只要电脑工作,就不依赖学校实验室了,所以有这个想法。
而现在我有这个条件,手头的课题,3年内资金没问题,所以我想学习3年,如果能出文章,以后就可以靠这个吃饭了。

但是有个疑惑,生物信息学的课题,是不是资助金额少呢?好像实验过程不花什么钱?如何做预算经费啊?
4楼2009-02-12 22:25:29
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windymoon6355

★ ★
司马诸葛(金币+2,VIP+0):谢谢交流 8-31 14:28
(我现在才大3)不过专业就是生物信息技术,感觉生信作为辅助很好,学生技什么的兼修生信的话,对自己帮助很大
而把生信当作主要方向的话就有很多问题……感觉工作就是一个问题```然后生信发小文章容易,真的要写一个很好很好的程序却很难,程序的难点应该是在算法上面,(当然,我承认我数学差。。虽然计算机学的还不错,但是要真的搞算法还是有点痛苦)我还是比较倾向于:算法就是数学……

学校的情况来看,生信因为是新专业,老师也很少,研究生也很稀有……本专业的同学也不怎么准备继续学生信~也许是我们没有恒心没有毅力,但是生信一路走下去真的不容易……

如果要说从哪开始,我推荐数学要有统计学,编程的话不忙学可视化编程直接学c/c++/java之类的(自己用的话,能写命令行的就够,要学语言的话,可能C++ Primer/Thinking in Java这一类的书比VB VC之类的更适合!),然后是算法,建议要学,《算法导论》很high,但是也很难啃完。。可以找一本高中信息奥赛的书(但是可能语言都是pascal的,如果看不懂pascal就痛苦了),高中的信息奥赛书基本上就是算法入门了~能深入一些计算机方面更好~~
(所以总结一下,难度:很大。。)
嗯。。大概就是这样~
继续重申我才大3:) 所以仅供参考了~呵呵
5楼2009-02-12 23:37:59
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ilovejim

银虫 (正式写手)

★ ★
司马诸葛(金币+2,VIP+0):谢谢交流 8-31 14:28
实验最好不要放,但可以把重心放在生物信息上。说实话现代生物学的发展已经完全离不开生物信息学的手段,一些生物信息的思维已经融合成生物学的一部分,离开它现代生物学无法进行。
精简,精致实验,进行生物信息挖掘或者建模分析加实验验证。现在物理学家出身的生物学家做的Quatative system biology(定量系统生物学,有时又叫做系统生物学),就主要做这方面的工作,他们注重数据整合分析挖掘,思维和思路是整体性的动态性的。 有人说生物信息在某一个角度上说是数据挖掘。当然还有更专业的,算法优化和研究新的算法。我想对于一个生物学出身的人来说,数据挖掘更适合一些也更好写。算法的应用实际上永远离不开生物学本身这个问题,不能脱离。它们是协作并进的,生物信息不可能超前吧。
一家之言,仅供参考。我在做病毒学研究,生物信息了解些,十分重视和对生物信息学方法挖掘实验数据或已有基因信息。
爱生活,然后---爱科学
6楼2009-02-13 10:06:57
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dragonkiss

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by phyco at 2009-02-11 10:28:37:
几年没有上来了,今天上来就回了你的帖子啊:)
我是做生物信息的,做了也有五六年了,也算有些经验。
看你的情况,想半路出家转生物信息,其实在生物领域换任何方向难度都差不多,只要努力总能克服。
生物信息 ...

建议很好,谢谢,我完全赞同。
看到好贴就要顶,这是对发贴人的尊重,也是发贴的原动力。
7楼2011-01-12 16:16:52
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