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majun04

木虫 (著名写手)

majun

[交流] 【求助】关于NBO分析键级

应用Gaussian03对化合物进行了NBO分析以后,期望从中得到键级的信息,现在不知道在输出文件中具体的哪部分是该信息,请高手赐教。
请问是不是从下面输出文件矩阵中的对应数字就是键级啊,比如说,C2-N14的键级是1.6717?

还有就是在输出文件中有如下信息:
Atom-atom overlap-weighted NAO bond order:   
(矩阵)
Atom-atom overlap-weighted NAO bond order, Totals by atom:
(数列)
MO bond order:  
(矩阵)
这些不同的键级都是从什么角度考虑的,又是怎么计算出来的?
请问这些又都是些什么信息啊,文章中要讨论的“键级”到底应该怎么从输出文件中读取?
现在有点糊涂,边上又没有课题问的人,现在请大家帮忙答疑一下。
谢谢!

是不是在计算细节部分给出( Wiberg bond index),就可以在后面的讨论部分用下图给出的数值讨论键级?

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 19:25 ]
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人

谢谢楼上,我的输入文件如下

%mem=1GB
%nprocshared=2
%chk=D:\222.chk
# ub3lyp/6-311g pop=nboread geom=connectivity

Title Card Required

0 2
B                  0.00000000    0.89787000    0.00000000
B                  0.77757800   -0.44893500    0.00000000
B                 -0.77757800   -0.44893500    0.00000000

1 2 1.0 3 1.0
2 3 1.0
3

$nbo bndidx $end

但好像算不了。计算的是硼的三聚体。你知道是什么原因吗?(这个结构是优化后的结果)

提示为

Structure accepted: No low occupancy Lewis orbitals

WARNING:  1 low occupancy (<0.9990e) core orbital  found on  B    1
           1 low occupancy (<0.9990e) core orbital  found on  B    2
           1 low occupancy (<0.9990e) core orbital  found on  B    3

           --- Apparent excited state configuration ---
The following "inverted" NBO labels reflect the actual hybrid overlap:

                 NBO  39 has been relabelled BD

Unable to label the NBOs properly:   8 unstarred orbitals
                                      7 occupied orbitals
Error
Error termination via Lnk1e in C:\G03W\l607.exe at Tue Feb 10 11:33:57 2009.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 10.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     11 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1

[ Last edited by yzcluster on 2009-2-10 at 11:35 ]
4楼2009-02-10 11:31:08
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人

LS你好

请问你是怎么给出这组数据的,用什么关键字?能说一下吗?

谢谢
2楼2009-02-10 10:44:51
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majun04

木虫 (著名写手)

majun


xuefei06(金币+1,VIP+0):thanks! 2-10 12:58
引用回帖:
Originally posted by yzcluster at 2009-2-10 10:44:
LS你好

请问你是怎么给出这组数据的,用什么关键字?能说一下吗?

谢谢

输入文件如下:
%chk=TBD-6-31+G_d-NBO.chk
%mem=400MW
%nproc=2
# pop=(nboread savenbos) b3lyp/6-31+G(d)

后面是分子结构式信息
(空行)
$nbo bndidx $end


手册150页有例题
乐观、执着、勤奋
3楼2009-02-10 10:55:22
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

输出文件中有没有什么错误信息?你发上来看看。
乐观、执着、勤奋
5楼2009-02-10 11:35:15
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