| 查看: 1392 | 回复: 12 | ||||
[求助]
配位水上的氢是关于镜面对称的，看了审稿意见仍然加不好，求助各位虫友，成分感激 已有3人参与
|
||||
|
以下是审稿意见： Hydrogens of the coordinated water molecules O(1W) and O(2W). Refining hydrogens in close proximity to a heavy atom, especially on room-temperature data, is seldom successful, especially as both O lie on a mirror plane, so in the suggested models each H is disordered between two positions. Thus, some O-H bonds are almost pointing towards the lanthanide atom, with unrealistically short H...Ln contacts of 2.10-2.35 Ang (in one case in 4, as short as 1.76 Ang). Then, these hydrogens do not make a sensible network of hydrogen bonds, which is improbable when there are plenty of acceptors (O) nearby. My suggestions are shown in the attached file 7.res. Here, O(2W) has its hydrogens related by the mirror plane, hence only one independent H with occupancy of 1. It forms a hydrogen bond with O(3W). Thus there is no hydrogen directed towards the metal. At O(1W), one H atom lies on the mirror plane (like the O itself) and forms H-bond with O(2W)(2-x, y, -z), related by twofold axis. The other H is disordered between two positions related by the mirror plane, and interacts with O(4A)(2-x,1-y,1-z). Note that the latter atom has occupancy of 0.5, which agrees well with the half-occupancy of the H. In this file, O(5W), O(6W) and O(7W) have increased occupancies, better fitting the electron density, so now there is 1.75 H2O per asymmetric unit, or 3.5 per formula unit, and the formula should be _chemical_formula_moiety ‘C23 H19 Er O10, 3.5(H2 O) ' _chemical_formula_sum 'C23 H26 Er O13.5' _chemical_formula_weight 686.35 _exptl_absorpt_coefficient_mu 3.798 _exptl_crystal_density_diffrn 1.724 Structures 4 and 5 can be treated similarly. |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 4.cif
- 附件 2 : 5.cif
- 附件 3 : 7.cif
2017-08-18 17:26:17, 314.94 K
2017-08-18 17:26:18, 268.73 K
2017-08-18 17:26:18, 245.85 K
» 猜你喜欢
江西科技师范大学物理化学课题组接收调剂生，12点开启，速来
已经有0人回复
-
【2026 考研调剂】哈尔滨工程大学 招收学硕调剂生（英语一、数学一）
已经有0人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有258人回复
-
四川轻化工大学化学与环境工程学院 付昱教授课题组招收调剂硕士研究生
已经有11人回复
-
大连化物所招收有机背景的博士候选人
已经有0人回复
-
在MOF中，有没有羧基参加配位的情况
已经有2人回复
-
招2026年入学上海交通大学博士生，急！！！
已经有1人回复
-
理论计算合作
已经有0人回复
我想更懂你29
专家顾问 (文坛精英)
-
专家经验: +1066 - 应助: 2668 (讲师)
- 贵宾: 0.483
- 金币: 86670
- 散金: 87
- 红花: 449
- 帖子: 11172
- 在线: 7876.8小时
- 虫号: 2622604
- 注册: 2013-08-29
- 性别: GG
- 专业: 原子簇化学
- 管辖: 无机/物化
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
shiandtian: 金币+96, 10 2017-08-21 20:31:45
感谢参与，应助指数 +1
shiandtian: 金币+96, 10 2017-08-21 20:31:45
| 审稿人说的很清楚了，O(2W)上只有一个独立的氢，与O(2W)有氢键作用，占有率是1，另一个可以对称操作得到；O(1W)上有两个氢，其中一个的占有率是1，与O(2W)有氢键作用，另一个氢的占有率为0.5，与O(4A)有氢键作用，所以当你grow之后，会出现三个氢原子是对的，其中一个的占有率是1，另两个的占有率是0.5，这样的话还是两个氢原子，根本原因在于O(1W)上两个氢原子，一个位于特殊位置，另一个位于一般位置 |
13楼2017-08-21 14:35:07
leaves922
木虫 (正式写手)
- 应助: 115 (高中生)
- 金币: 2783.7
- 红花: 18
- 帖子: 418
- 在线: 32.5小时
- 虫号: 4451315
- 注册: 2016-03-01
- 性别: MM
- 专业: 分析化学
2楼2017-08-18 17:36:02
3楼2017-08-18 19:13:07
4楼2017-08-19 09:39:44
leaves922
木虫 (正式写手)
- 应助: 115 (高中生)
- 金币: 2783.7
- 红花: 18
- 帖子: 418
- 在线: 32.5小时
- 虫号: 4451315
- 注册: 2016-03-01
- 性别: MM
- 专业: 分析化学
|
非特殊位置的更改一部分H的指向，特殊位置的水分子无序要做part-1，如果特殊位置都在part-1有键连，要单独拿出来做part-2，而且特殊位置的占据数都是0.5 发自小木虫IOS客户端 |
5楼2017-08-19 09:59:01
匿名
用户注销 (知名作家)
精修问题可私信
- CMEI: 2
- 应助: 2712 (讲师)
- 贵宾: 0.836
- 金币: 38475.5
- 散金: 1801
- 红花: 400
- 帖子: 5825
- 在线: 1932.4小时
- 虫号: 0
- 注册: 2008-10-05
- 性别: GG
- 专业: 药物分析
- 管辖: 晶体
6楼2017-08-19 12:26:11
7楼2017-08-19 16:01:14
8楼2017-08-19 16:02:47
leaves922
木虫 (正式写手)
- 应助: 115 (高中生)
- 金币: 2783.7
- 红花: 18
- 帖子: 418
- 在线: 32.5小时
- 虫号: 4451315
- 注册: 2016-03-01
- 性别: MM
- 专业: 分析化学
shiandtian9楼2017-08-19 16:19:25
xwnail2003
禁虫 (著名写手)
|
本帖内容被屏蔽 |
10楼2017-08-19 16:41:20