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极北小白熊

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[求助] 你好，本人在做大豆chip-seq，但chip出的核酸浓度总... 已有2人参与

你好，本人在做大豆chip-seq，但chip出的核酸浓度总是很低，标签用的是myc- ，抗体是商品化的，磁珠和琼脂糖珠都用过，效果总是不好，目的基因表达量检测过没有问题，很高的，求指导，， @biostar2009

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1楼 2017-08-18 07:22:17

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txwznb

禁虫 (初入文坛)

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6楼2017-08-18 08:42:45

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zhouxfd

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【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-08-27 09:35:05

换flag试试吧，有时候myc可能不好用，另外chip后WB能捡到带吗

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2楼2017-08-18 07:25:51

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load1

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你们实验室用同样的磁珠和标签做成功过吗？提供更多的信息，我们才可以对应排出

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3楼2017-08-18 07:42:59

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2楼: Originally posted by zhouxfd at 2017-08-18 07:25:51
换flag试试吧，有时候myc可能不好用，另外chip后WB能捡到带吗

chip之后没做过wb，不过单独提蛋白做过wb没问题，，只是沉淀出的核酸浓度都是一位数，没法测序

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4楼2017-08-18 07:45:25

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3楼: Originally posted by load1 at 2017-08-18 07:42:59
你们实验室用同样的磁珠和标签做成功过吗？提供更多的信息，我们才可以对应排出

没有，我是第一个做的，我们实验室之前没有人做过。。

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5楼2017-08-18 07:50:24

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18064074161

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WB验证没问题的话，正常富集可能会出现浓度较低，你可以了解一下微量建库，少量IP依旧可以测序的，本身植物IP就很费时费力，做很多次样品也是问题，心很累。

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7楼2017-08-21 16:31:56

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8楼2017-08-21 17:14:59

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Zoe-dream

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想请问一下，你的抗体用的启动子是35s还是自己基因的启动子？

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9楼2017-08-26 18:39:04

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9楼: Originally posted by Zoe-dream at 2017-08-26 18:39:04
想请问一下，你的抗体用的启动子是35s还是自己基因的启动子？

3×35s启动子，定量已经检测单过量表达，并且wb检测到标签蛋白，

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10楼2017-08-27 23:30:52

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