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极北小白熊

铁虫 (正式写手)

[求助] 你好,本人在做大豆chip-seq,但chip出的核酸浓度总... 已有2人参与

你好,本人在做大豆chip-seq,但chip出的核酸浓度总是很低,标签用的是myc-  ,抗体是商品化的,磁珠和琼脂糖珠都用过,效果总是不好,目的基因表达量检测过没有问题,很高的,求指导,, @biostar2009

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txwznb

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

6楼2017-08-18 08:42:45
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zhouxfd

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-08-27 09:35:05
换flag试试吧,有时候myc可能不好用,另外chip后WB能捡到带吗
2楼2017-08-18 07:25:51
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load1

新虫 (小有名气)

你们实验室用同样的磁珠和标签做成功过吗?提供更多的信息,我们才可以对应排出

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3楼2017-08-18 07:42:59
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极北小白熊

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhouxfd at 2017-08-18 07:25:51
换flag试试吧,有时候myc可能不好用,另外chip后WB能捡到带吗

chip之后  没做过wb,不过单独提蛋白做过wb没问题,,只是沉淀出的核酸浓度都是一位数,没法测序

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4楼2017-08-18 07:45:25
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极北小白熊

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by load1 at 2017-08-18 07:42:59
你们实验室用同样的磁珠和标签做成功过吗?提供更多的信息,我们才可以对应排出

没有,我是第一个做的,我们实验室之前没有人做过。。

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5楼2017-08-18 07:50:24
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18064074161

新虫 (初入文坛)


WB验证没问题的话,正常富集可能会出现浓度较低,你可以了解一下微量建库,少量IP依旧可以测序的,本身植物IP就很费时费力,做很多次样品也是问题,心很累。

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7楼2017-08-21 16:31:56
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极北小白熊

铁虫 (正式写手)

内容已删除
8楼2017-08-21 17:14:59
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Zoe-dream

新虫 (初入文坛)

想请问一下,你的抗体用的启动子是35s还是自己基因的启动子?

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9楼2017-08-26 18:39:04
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极北小白熊

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by Zoe-dream at 2017-08-26 18:39:04
想请问一下,你的抗体用的启动子是35s还是自己基因的启动子?

3×35s启动子,定量已经检测单过量表达,并且wb检测到标签蛋白,

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10楼2017-08-27 23:30:52
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