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土壤DNA提取 已有2人参与
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土壤微生物如果是保存原因，导致土壤DNA提取含量较低，条带不清楚，能否采用培养基定向分类培养，扩大微生物数量的方法进行后再提取土壤的DNA呀，还是应该怎么处理？求这方面的专家给出见解，不甚感激 发自小木虫Android客户端 |
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snoopytbw
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2楼2017-08-16 08:53:28
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3楼2017-08-16 09:01:55
zhsmxfx
金虫 (小有名气)
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4楼2017-08-16 09:19:00
5楼2017-08-21 17:18:00
【答案】应助回帖
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如果是由于样本保存的原因，条带如果有拖尾的话，说明里面DNA已经降解了。（不过在现实中，及时是不放到-20或-80保存，土壤中应该也有微生物存在，特别是细菌的）。看你做什么了，如果做细菌，那么可以用16S的一段如（V3-V4）或（V4-V5），对抽提的DNA进行扩增，看看是否能扩出来。在我们公司的实际操作中，有时候土壤总DNA提的效果不好，但是16S的一段却扩的很好，如果这个扩的很好，也是也可以用的。你可以试一下。还有，也有可能是提取试剂盒的原因，你可以用一下天根的土壤DNA抽提试剂盒，效果不错的。建议不要用培养基定性培养，因为会改变里面微生物的群落结构。 如果真的是保存原因，那就只能重新取样了。 |
6楼2017-08-21 17:22:03
7楼2018-03-16 10:11:26
xiayuran
银虫 (小有名气)
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8楼2021-11-06 07:03:53
9楼2021-11-06 10:43:37