24小时热门版块排行榜    

查看: 1201  |  回复: 8

18699725315

新虫 (初入文坛)

[求助] 土壤DNA提取 已有2人参与

土壤微生物如果是保存原因,导致土壤DNA提取含量较低,条带不清楚,能否采用培养基定向分类培养,扩大微生物数量的方法进行后再提取土壤的DNA呀,还是应该怎么处理?求这方面的专家给出见解,不甚感激

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
小冀-: 金币+1, 应助指数+1, 鼓励回帖交流 2017-08-16 09:42:49
培养后,菌群结构显著改变了,大量的优势菌把其他微生物全盖掉了。。肯定不行的。建议用专业的土壤DNA提取试剂盒,好像是罗氏的,有点贵,且操作很繁琐,优点是效率很高,提DNA很浓。自己查下好了。
2楼2017-08-16 08:53:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Only菱花

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

3楼2017-08-16 09:01:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhsmxfx

金虫 (小有名气)

4楼2017-08-16 09:19:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微基生物

捐助贵宾 (小有名气)

技术专员

引用回帖:
3楼: Originally posted by Only菱花 at 2017-08-16 09:01:55
怎么土壤也有DNA的吗?把我看糊涂了,看来孤陋寡闻了……

土壤里面有微生物,微生物有DNA。
专注微生物多样性分析QQ2758452825
5楼2017-08-21 17:18:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微基生物

捐助贵宾 (小有名气)

技术专员

【答案】应助回帖

如果是由于样本保存的原因,条带如果有拖尾的话,说明里面DNA已经降解了。(不过在现实中,及时是不放到-20或-80保存,土壤中应该也有微生物存在,特别是细菌的)。看你做什么了,如果做细菌,那么可以用16S的一段如(V3-V4)或(V4-V5),对抽提的DNA进行扩增,看看是否能扩出来。在我们公司的实际操作中,有时候土壤总DNA提的效果不好,但是16S的一段却扩的很好,如果这个扩的很好,也是也可以用的。你可以试一下。还有,也有可能是提取试剂盒的原因,你可以用一下天根的土壤DNA抽提试剂盒,效果不错的。建议不要用培养基定性培养,因为会改变里面微生物的群落结构。
如果真的是保存原因,那就只能重新取样了。
专注微生物多样性分析QQ2758452825
6楼2017-08-21 17:22:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

学爱临风

铁虫 (初入文坛)

土壤中含有大量的腐殖酸等酸类物质,对提取DNA有很大的影响。建议可以看看《土壤微生物DNA提取方法的研究》西北大学学报,2009,39(5)
7楼2018-03-16 10:11:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiayuran

银虫 (小有名气)

有大部分菌是不可培养的,会丢失很多信息,建议直接用试剂盒提取

发自小木虫Android客户端
8楼2021-11-06 07:03:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菠萝生煎

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 微基生物 at 2017-08-21 17:22:03
如果是由于样本保存的原因,条带如果有拖尾的话,说明里面DNA已经降解了。(不过在现实中,及时是不放到-20或-80保存,土壤中应该也有微生物存在,特别是细菌的)。看你做什么了,如果做细菌,那么可以用16S的一段如 ...

学到了

发自小木虫IOS客户端
9楼2021-11-06 10:43:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 18699725315 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 10/500 2026-11-02 06:16 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 13/650 2026-11-02 06:03 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 10/500 2026-11-02 06:00 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 9/450 2026-11-02 05:54 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 17/850 2026-11-02 05:34 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 4/200 2026-11-02 03:50 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 9/450 2026-11-02 03:26 by xzcv0Tehd8lQ
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 22:27 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:27 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 22:24 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 7/350 2026-11-01 22:01 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 21:45 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 22/1100 2026-11-01 16:35 by BCdvBAEpt3zm
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 14:48 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 越来越担心硕士毕业后没有竞争力了 +9 zuesli 2026-10-27 15/750 2026-11-01 12:59 by Equinoxhua
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 3/150 2026-11-01 12:53 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 12:40 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 17/850 2026-11-01 12:24 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 16/800 2026-11-01 12:14 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 2027博士申请-临床检验诊断学、病原生物学、微生物方向 50+3 yyh@ 2026-10-28 4/200 2026-10-31 12:47 by 可淡不可忘
信息提示
请填处理意见