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Nec99

新虫 (小有名气)

[交流] P成这样 是不是得重新设计引物?

用PCR引物做模版二次P,有一个亮的引物,其他的都拖尾 是因为引物不行得重新设计吗?已经试过退火温度调为60、58 还是不行 循环数也用40和35P过。延伸时间1分半 各位大神怎么办?

P成这样 是不是得重新设计引物?


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pijuan1154

新虫 (初入文坛)


Nec99(晋鹏代发): 金币+1, 鼓励回帖交流~ 2017-08-07 20:05:30
模板浓度太高了
2楼2017-08-07 10:20:49
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高chengbin

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
Nec99(晋鹏代发): 金币+2, 鼓励回帖交流~ 2017-08-15 23:26:50
1:样品浓度过高。这种情况稀释一下就行了。提质粒的时候常出现这种情况。
2:蛋白杂质阻碍DNA的泳动。提基因组DNA时常出现这种情况。
以上两种情况,拖尾都是在电泳条带的后面。
3:样品破碎或是被降解
4:存在RNA
这两种情况,拖尾都是在电泳条带的前面。
      PCR产物电泳拖尾,主要从以下两个方面考虑:
1、PCR产物自身原因:往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多,而造成PCR的非特异性产物过多。
对策:①减少Taq酶的量,或调换另一来源的酶。②减少dNTP的浓度。③适当降低Mg2+浓度。④增加模板量,减少引物的用量,减少循环次数,提高退火温度。
2、电泳体系的问题:
(1)电泳缓冲液TAE或者TBE的污染,建议更换缓冲液。
(2)上样时样品漂了,建议增加上样缓冲液的用量,以及小心加样。
(3)电压太高。
(4)适当把你的胶的浓度加大。(根据你的片断大小而定)
(5)观察你的marker是否也存在拖尾现象,作为对照。
3楼2017-08-15 20:01:32
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