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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » iTRAQ蛋白质组学相关问题
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melodysese

金虫 (著名写手)

[交流] iTRAQ蛋白质组学相关问题

我做iTRAQ的物种，之前没有人做过基因组和转录组，所以用的植物界总蛋白来鉴定可信蛋白的，也就是鉴定出的蛋白质都是其它物种的。因为我没找到和我情况类似的文献参考，，所以不知如何撰写讨论呢，大家遇到过这种情况或者这种情况的文献吗，急求赐教！金币奉上！
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1楼 2017-08-06 16:57:23
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laop_530

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by melodysese at 2017-08-08 20:27:40
老师估计不会再做的，一是没有样品了，而是实验设计本身够悬...

正常样本就可以，不做的话你只能用总库搜了，但分析结果不一好

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9楼2017-08-09 14:42:50
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笑侠楚留香

新虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-08-09 07:49:15
楼主研究的是很生僻的植物吗，如果是这种情况最好有该物种的转录组数据，实在没有的话只能映射到模式生物的蛋白数据库来鉴定了。
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蛋白组学/代谢组学
2楼2017-08-06 23:20:43
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jinkairui123

铁虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这种还是找几篇文章参考一下吧，肯定有的
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武汉金开瑞生物，提供核酸和蛋白的整体研究方案
3楼2017-08-07 16:07:51
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melodysese

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 笑侠楚留香 at 2017-08-06 23:20:43
楼主研究的是很生僻的植物吗，如果是这种情况最好有该物种的转录组数据，实在没有的话只能映射到模式生物的蛋白数据库来鉴定了。

我做的两面针的种子，芸香科的植物，好像芸香科的植物做的人不多。我用的是植物总蛋白，不是模式植物拟南芥烟草番茄之类的的。所以很苦恼。

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4楼2017-08-08 09:20:40
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