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低调de往前走新虫 (初入文坛)
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求助:Vasp计算Bader电荷问题,Ben-NH2中氨基的净Bader电荷计算值与理论相反
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用Vasp计算氨基苯(Ben-NH2)中氨基的Bader电荷,结果如下: ACF.dat文件: 6、7是氨基上的两个H原子,14是N原子,所以氨基现在的电荷是0.4784+0.4644+6.4067=7.3495 减去氨基的7个价电子,也就是氨基多了0.3495电子,而理论上苯环上的氨基应该是电子给体 为什么会多了电子呢,请大神帮忙看一看。 # X Y Z CHARGE MIN DIST ATOMIC VOL -------------------------------------------------------------------------------- 1 7.8081 9.4480 9.5463 0.8880 0.2912 764.7257 2 12.8020 9.4859 9.5165 0.9014 0.2992 1048.0155 3 11.5513 11.6320 9.6024 0.8547 0.1684 985.8867 4 11.5729 7.2986 9.4594 0.8499 0.1749 1326.9372 5 9.0634 7.3036 9.4604 0.8422 0.2288 1212.0266 6 7.9297 11.8769 9.3592 0.4784 0.0708 1169.3560 7 9.3898 12.7242 9.3840 0.4644 0.0291 823.1664 8 8.9071 9.4561 9.5406 4.0407 0.4981 72.2097 9 9.5924 10.6888 9.5860 3.8599 0.3285 40.0318 10 11.0037 10.6795 9.5710 3.9833 0.5308 69.6469 11 11.7047 9.4694 9.5267 4.0632 0.4956 75.2214 12 11.0200 8.2446 9.4925 4.2242 0.5326 86.0362 13 9.6165 8.2507 9.4962 4.1429 0.5510 69.8123 14 8.8857 11.9011 9.7247 6.4067 0.6562 256.9276 -------------------------------------------------------------------------------- VACUUM CHARGE: 0.0000 VACUUM VOLUME: 0.0000 NUMBER OF ELECTRONS: 36.0000 INCAR文件: SYSTEM = NH2-BEN ISTART = 0 ICHARG = 2 NELM = 100 NELMIN = 2 #LCHARG = F #LWAVE= F PREC = Medium GGA = PE ENCUT = 300 EDIFF = 1E-4 EDIFFG = -0.02 NSW = 1000 ISYM = 2 NPAR = 1 ISMEAR = -5 IBRION = 2 #ISPIN = 2 #MAGMOM = 48*0 46*0 10 10 #LDAU = .TURE. #LDAUTYPE = 2 #LDAUL = -1 -1 3 #LDAUU = 0 0 7.4 #LDAUJ = 0 0 0.5 #LDAUPRINT = 2 LORBIT = 10 LREAL = Auto ISIF = 2 #NGX = 58 #NGY = 54 #NGZ = 90 结构是在MS中构建的,Ben-NH2分子的晶格是20埃的立方体。 |
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4楼2017-08-09 08:42:21
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