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低调de往前走

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助:Vasp计算Bader电荷问题,Ben-NH2中氨基的净Bader电荷计算值与理论相反

用Vasp计算氨基苯(Ben-NH2)中氨基的Bader电荷,结果如下:
ACF.dat文件:      
6、7是氨基上的两个H原子,14是N原子,所以氨基现在的电荷是0.4784+0.4644+6.4067=7.3495
减去氨基的7个价电子,也就是氨基多了0.3495电子,而理论上苯环上的氨基应该是电子给体
为什么会多了电子呢,请大神帮忙看一看。
    #         X                Y              Z          CHARGE     MIN DIST    ATOMIC VOL
--------------------------------------------------------------------------------
    1      7.8081       9.4480      9.5463      0.8880      0.2912           764.7257
    2     12.8020      9.4859      9.5165      0.9014      0.2992          1048.0155
    3     11.5513     11.6320     9.6024      0.8547      0.1684          985.8867
    4     11.5729      7.2986      9.4594      0.8499      0.1749         1326.9372
    5      9.0634       7.3036      9.4604      0.8422      0.2288         1212.0266
    6      7.9297     11.8769      9.3592      0.4784      0.0708        1169.3560
    7      9.3898     12.7242      9.3840      0.4644      0.0291        823.1664
    8      8.9071       9.4561      9.5406      4.0407      0.4981         72.2097
    9      9.5924     10.6888      9.5860      3.8599      0.3285         40.0318
   10     11.0037   10.6795      9.5710      3.9833      0.5308         69.6469
   11     11.7047     9.4694      9.5267      4.0632      0.4956        75.2214
   12     11.0200     8.2446      9.4925      4.2242      0.5326        86.0362
   13      9.6165      8.2507      9.4962      4.1429      0.5510        69.8123
   14      8.8857     11.9011      9.7247     6.4067      0.6562        256.9276
--------------------------------------------------------------------------------
    VACUUM CHARGE:               0.0000
    VACUUM VOLUME:               0.0000
    NUMBER OF ELECTRONS:        36.0000

INCAR文件:
SYSTEM = NH2-BEN
ISTART = 0
ICHARG = 2
NELM = 100         
NELMIN = 2  
#LCHARG = F
#LWAVE= F
PREC = Medium
GGA = PE
ENCUT = 300
EDIFF = 1E-4
EDIFFG = -0.02
NSW = 1000
ISYM = 2
NPAR = 1
ISMEAR = -5
IBRION = 2
#ISPIN = 2
#MAGMOM = 48*0 46*0 10  10
#LDAU = .TURE.
#LDAUTYPE = 2
#LDAUL = -1 -1 3
#LDAUU = 0 0 7.4
#LDAUJ = 0 0 0.5
#LDAUPRINT = 2      
LORBIT = 10
LREAL = Auto
ISIF = 2
#NGX = 58  
#NGY = 54  
#NGZ = 90

结构是在MS中构建的,Ben-NH2分子的晶格是20埃的立方体。
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苦心人天不负
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低调de往前走

新虫 (初入文坛)

自己顶,不要沉啊
苦心人天不负
2楼2017-08-06 22:45:07
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南墙2014

木虫 (正式写手)

顶一下,我前天的算的结果是N多课0.31e。同样困惑。
3楼2017-08-07 15:32:43
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低调de往前走

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 南墙2014 at 2017-08-07 15:32:43
顶一下,我前天的算的结果是N多课0.31e。同样困惑。

搞不明白什么原因

发自小木虫IOS客户端
苦心人天不负
4楼2017-08-09 08:42:21
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低调de往前走

新虫 (初入文坛)

苦心人天不负
5楼2017-08-10 22:30:25
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低调de往前走

新虫 (初入文坛)

苦心人天不负
6楼2017-08-14 08:55:47
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鱼儿Pamela

铁虫 (初入文坛)

我遇到了跟你同样的问题,请问你现在解决了这个问题吗
7楼2020-12-27 14:09:32
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