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莘芷

新虫 (初入文坛)

[求助] 您好，老师！目前我有一个物种的转录组unigene，现在我需... 已有1人参与

您好，老师！目前我有一个物种的转录组unigene，现在我需要从这些unigene中筛选出CYP450酶的基因，根据NCBI的比对结果，我筛选出645条unigene，但现在我不知道具体哪一天unigene是我所需要的，所以我应该怎样做才能缩小范围，尽快找出目标unigene?

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1楼 2017-07-28 16:47:37
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合欢花的忧伤

新虫 (著名写手)
看表达量

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2楼2017-07-30 09:34:11
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莘芷

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 合欢花的忧伤 at 2017-07-30 09:34:11
看表达量

怎样看表达量呢

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3楼2017-07-31 09:02:25
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lzh860801

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
LZ问题描述的不清楚，
如果只是寻找编码CYP450酶的基因，那么你的NCBI结果就是了，
但是你这里明显是有更具体的要求的，那肯定就需要结合其他信息来进一步筛选了，如同2L所说的看表达量就是其中一种，从你的645个候选中筛选出在你关注点上高表达的基因，这部份就可能是你正在需要的；
当然这部筛选后很可能依旧会存在很多个候选，那你就需要结合其他的实验材料来设计了，你这里情况说的太简单，别人没办法帮你
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4楼2017-07-31 11:21:52
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莘芷

新虫 (初入文坛)
我现在只有Nr,Swissport,COG,KEGG的比对结果，可不可以根据这几项进行筛选呢 @hc-material

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5楼2017-07-31 15:15:55
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hc-material

专家顾问 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 莘芷 at 2017-07-31 15:15:55
我现在只有Nr,Swissport,COG,KEGG的比对结果，可不可以根据这几项进行筛选呢 hc-material

可以的
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6楼2017-07-31 22:24:31
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莘芷

新虫 (初入文坛)
那我具体应该怎样进行呢，我对这方面不是很懂，还望能不吝赐教 @hc-material

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7楼2017-08-01 09:39:58
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