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关于Heatmap的做法
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1937mcq
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关于Heatmap的做法
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如题,目前已经有基因的表达数据,需要做成热力图,但是完全不会,,需要请教,望知无不言,做成的图应该是如下图所示,
A@Z6UK3~WZU%]_IFRS%`Y_N.png
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心若向阳,无谓悲伤!
1楼
2017-07-28 14:28:40
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6楼
:
Originally posted by
喝杯奶茶先
at 2020-04-04 11:14:40
需要R语言吗
...
不需要,提交txt的数据文件即可。R其实也不难,网上有包调用,适合你做个性化的图。
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10楼
2020-04-04 14:59:45
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可以用TMeV来做,把你基因的FPKm表达量的值求log2()对数,然后求所有log2()的平均值和标准差,再用每一个log值减去平均值再除以标准差,得到Z值,然后用Z值数据去tmev作图就好啦
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竹杖芒鞋轻胜马,谁怕,一蓑烟雨任平生;回首向来萧瑟处,归去,也无风雨也无晴
2楼
2017-12-31 00:28:46
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专业: 基因表达调控与表观遗传学
现在好多云平台工具可以做,比如百迈克,基迪奥他们的平台,数据归一化什么参数自己选就可以了。注册一个帐号,小工具免费的
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3楼
2018-01-16 09:02:33
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HemI这个软件可以做。不过要看你的数据是什么样的了
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4楼
2018-04-18 00:54:23
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