24小时热门版块排行榜    

查看: 5542  |  回复: 14

1937mcq

金虫 (初入文坛)

努力后生

[求助] 关于Heatmap的做法 已有1人参与

如题,目前已经有基因的表达数据,需要做成热力图,但是完全不会,,需要请教,望知无不言,做成的图应该是如下图所示,

关于Heatmap的做法
A@Z6UK3~WZU%]_IFRS%`Y_N.png
回复此楼
心若向阳,无谓悲伤!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MAS_rice

至尊木虫 (著名写手)

可以用TMeV来做,把你基因的FPKm表达量的值求log2()对数,然后求所有log2()的平均值和标准差,再用每一个log值减去平均值再除以标准差,得到Z值,然后用Z值数据去tmev作图就好啦

发自小木虫IOS客户端
竹杖芒鞋轻胜马,谁怕,一蓑烟雨任平生;回首向来萧瑟处,归去,也无风雨也无晴
2楼2017-12-31 00:28:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xsqxmc

新虫 (著名写手)

现在好多云平台工具可以做,比如百迈克,基迪奥他们的平台,数据归一化什么参数自己选就可以了。注册一个帐号,小工具免费的

发自小木虫Android客户端
3楼2018-01-16 09:02:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木元雨

木虫 (职业作家)

HemI这个软件可以做。不过要看你的数据是什么样的了

发自小木虫Android客户端
4楼2018-04-18 00:54:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小乌贼

金虫 (正式写手)

5楼2020-04-04 09:04:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

喝杯奶茶先

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xsqxmc at 2018-01-16 09:02:33
现在好多云平台工具可以做,比如百迈克,基迪奥他们的平台,数据归一化什么参数自己选就可以了。注册一个帐号,小工具免费的

需要R语言吗

发自小木虫IOS客户端
6楼2020-04-04 11:14:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

喝杯奶茶先

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 小小乌贼 at 2020-04-04 09:04:30
tbtools

需要R语言加持吧

发自小木虫IOS客户端
7楼2020-04-04 11:15:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小乌贼

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 喝杯奶茶先 at 2020-04-04 11:14:40
需要R语言吗
...

就是网页上的,数据存excel里,拖进去就出来了

发自小木虫Android客户端
8楼2020-04-04 11:30:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小乌贼

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 喝杯奶茶先 at 2020-04-04 11:15:22
需要R语言加持吧
...

不需要

发自小木虫Android客户端
9楼2020-04-04 11:30:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xsqxmc

新虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 喝杯奶茶先 at 2020-04-04 11:14:40
需要R语言吗
...

不需要,提交txt的数据文件即可。R其实也不难,网上有包调用,适合你做个性化的图。

发自小木虫Android客户端
10楼2020-04-04 14:59:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 1937mcq 的主题更新
信息提示
请填处理意见