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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 关于Heatmap的做法
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1937mcq

金虫 (初入文坛)

努力后生

[求助] 关于Heatmap的做法 已有1人参与

如题，目前已经有基因的表达数据，需要做成热力图，但是完全不会，，需要请教，望知无不言，做成的图应该是如下图所示，

关于Heatmap的做法
A@Z6UK3~WZU%]_IFRS%`Y_N.png
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心若向阳，无谓悲伤！
1楼 2017-07-28 14:28:40
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MAS_rice

至尊木虫 (著名写手)
可以用TMeV来做，把你基因的FPKm表达量的值求log2()对数，然后求所有log2()的平均值和标准差，再用每一个log值减去平均值再除以标准差，得到Z值，然后用Z值数据去tmev作图就好啦

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竹杖芒鞋轻胜马，谁怕，一蓑烟雨任平生；回首向来萧瑟处，归去，也无风雨也无晴
2楼2017-12-31 00:28:46
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xsqxmc

新虫 (著名写手)
现在好多云平台工具可以做，比如百迈克，基迪奥他们的平台，数据归一化什么参数自己选就可以了。注册一个帐号，小工具免费的

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3楼2018-01-16 09:02:33
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木元雨

木虫 (职业作家)
HemI这个软件可以做。不过要看你的数据是什么样的了

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4楼2018-04-18 00:54:23
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小小乌贼

金虫 (正式写手)
tbtools

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5楼2020-04-04 09:04:30
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喝杯奶茶先

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xsqxmc at 2018-01-16 09:02:33
现在好多云平台工具可以做，比如百迈克，基迪奥他们的平台，数据归一化什么参数自己选就可以了。注册一个帐号，小工具免费的

需要R语言吗

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6楼2020-04-04 11:14:40
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喝杯奶茶先

银虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小小乌贼 at 2020-04-04 09:04:30
tbtools

需要R语言加持吧

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7楼2020-04-04 11:15:22
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小小乌贼

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 喝杯奶茶先 at 2020-04-04 11:14:40
需要R语言吗
...

就是网页上的，数据存excel里，拖进去就出来了

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8楼2020-04-04 11:30:01
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小小乌贼

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 喝杯奶茶先 at 2020-04-04 11:15:22
需要R语言加持吧
...

不需要

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9楼2020-04-04 11:30:14
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xsqxmc

新虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 喝杯奶茶先 at 2020-04-04 11:14:40
需要R语言吗
...

不需要，提交txt的数据文件即可。R其实也不难，网上有包调用，适合你做个性化的图。

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10楼2020-04-04 14:59:45
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