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youngsun50

木虫 (正式写手)

[求助] 用质粒做real-time PCR标准曲线,效果差。求助!已有2人参与

各位虫友,我用real-time PCR做Albumin的标准曲线,是用克隆了albumin序列的重组质粒做逐级10倍稀释(10^6 到10^0拷贝)。之前做过好多次,效果都很好,定量范围(即两个10倍稀释点之间的△Ct:2.6~4.0;复孔的△Ct<1.5)能够到10个拷贝。我3月1日做还是可以的,到3月15日再做,就开始变差了,这两次的条件包括质粒和试剂都没变。最近多次做的效果都能差,一些10倍稀释点之间的△Ct都>4.0,有时候有的点的复孔△Ct也>1.5。
我尝试过消除可能的原因,包括把引物和探针都新合成,质粒重新克隆并提取,换其他牌子的PCR mastermix, 结果都没有改善。
请给予建议或分析可能的原因,谢谢!
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学会感恩,强大自我
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youngsun50

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-07-26 16:34:37
1、一般情况,三个点都太少,一般还是要5个可以统计分析的点,而且最少也要做2个重复,否则,你的结果很有可能是一种偶然现象,一般R值要达到0.98才行。

2、进行相对定量不做标准曲线,不计算扩增效率而直接应用D ...

谢谢这位童鞋!
不过一些地方你误会我了 逐条回复你的评论
1. 我的10^6 到 10^0, 已经7个点,且duplicate。
2. 我做的不是△△Ct法, 我是绝对定量,用质粒做标准曲线来定量我的样本(gDNA)。
3. 4. 我学习了, 谢谢

我遇到的问题,你有什么高见?
学会感恩,强大自我
3楼2017-07-26 17:14:44
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