应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】如何利用MD进行模拟退火
161/2返回列表12下一页
查看: 2170  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

amoschen

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何利用MD进行模拟退火

请问应该如何利用MD进行模拟退火？我是新手，在看到一篇文献----“苯并三唑与氧化亚铜晶体相互作用的MD模拟”中讲到：“为了克服空间取样缓慢的难题，采用了模拟退火技术”但是没有说明具体的做法，请教各位高手可不可以详细的解释一下模拟退火的具体做法。
      感激不尽！谢谢

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-21 at 15:10 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-02-02 10:22:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
★ ★ ★
lei0736(金币+3):谢谢 2-3 10:29
你要进行分子动力学得用MD软件吧，基本MD程序都可以进行分子动力学模拟的退火模拟，你所要做的只是学习软件使用方法，即怎么去退火而已
赞一下(10人) 回复此楼
个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
2楼2009-02-02 11:34:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★
gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢！ 2-4 22:44
升温再降温
回复此楼
3楼2009-02-02 12:32:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2-3 10:30
引用回帖:
Originally posted by gwdavid at 2009-2-2 11:34:
你要进行分子动力学得用MD软件吧，基本MD程序都可以进行分子动力学模拟的退火模拟，你所要做的只是学习软件使用方法，即怎么去退火而已

呵呵，你要是特别喜欢的话（打死俺也不信！），
你可以自己编一个模拟退火的程序，
再在这个程序中，调用一个动力学软件/模块。
赞一下(10人) 回复此楼
4楼2009-02-02 18:45:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
★
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎参加讨论 3-16 12:50
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2009/2/2 18:45:


呵呵，你要是特别喜欢的话（打死俺也不信！），
你可以自己编一个模拟退火的程序，
再在这个程序中，调用一个动力学软件/模块。

老汉说到这里，我突然想到，不管是论坛里还是QQ群里，都经常有朋友说到“自己编段程序”，但是我想多数人还是对此处于混沌状态，你觉得您单独开个帖扫盲一下在“计算模拟领域”要写程序时，语言选择，工具选择，平台（OS）选择方面的问题是否可行？说实话也有些私心哦，呵呵，狂想看
赞一下(6人) 回复此楼
个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
5楼2009-02-03 22:11:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★
gwdavid(金币+1,VIP+0):呵呵！ 2-4 22:44
引用回帖:
Originally posted by gwdavid at 2009-2-3 22:11:
老汉说到这里，我突然想到，不管是论坛里还是QQ群里，都经常有朋友说到“自己编段程序”，但是我想多数人还是对此处于混沌状态，你觉得您单独开个帖扫盲一下在“计算模拟领域”要写程序时，语言选择，工具选择 ...

嘻嘻，你要累死/勒死俺不成？
别着急，现在科学出版社和化学化工出版社正在组稿，关于科学领域中的计算模拟方面的。
不过，俺看将开发的还是太少。
明天吧，不，明年吧。总不能都是“被逼的”。
赞一下(10人) 回复此楼
6楼2009-02-04 11:30:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
科学出版社和化学化工出版社正在组稿？这是什么意思啊？
赞一下 回复此楼
个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
7楼2009-02-04 11:44:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★
gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢！ 2-4 22:44
引用回帖:
Originally posted by gwdavid at 2009-2-4 11:44:
科学出版社和化学化工出版社正在组稿？这是什么意思啊？

每隔一段时间，出版社都会计划出版一套反映学科发展的专著。
赞一下(10人) 回复此楼
8楼2009-02-04 16:46:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
支持开个帖扫盲一下在“计算模拟领域”要写程序时，语言选择，工具选择，平台（OS）选择方面的问题。
赞一下 回复此楼
9楼2009-02-06 09:35:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 欢迎高手常来 2-10 09:18
自己写程序，自己用，不需要在语言、工具、平台方面做什么选择，自己熟悉什么就用什么吧。

以前，用fortran的很多。我最早是用Qbasic，后来都是用fortran了。但是现在，用c++的越来越多，还有不少使用matlab等工具软件的。

如果你计算中需要大量的矩阵相关运算，或者需要解方程之类的，就不妨学学使用matlab、Mathematica、scilab、octave等这些数学工具软件，这些软件的好处是有很多数学处理过程都被做成了现成的函数，而且在计算过程中可以随时作图，考察计算结果。scilab和octave都是免费软件，我个人很支持使用这样的免费软件。

如果你想搞个比较好的界面，可以用VB，Vc等来开发，当然也可用matlab。

如果你比较重视自己设计算法，比如想在节省运算时间和节省内存之间做出选择，或者并不重视界面开发和图形显示，可以用fortran或一般的c++等语言。

关于平台选择，我看无所谓。不过Linux下的免费编译软件比较多。

[ Last edited by 老虎大王 on 2009-2-10 at 10:30 ]
赞一下(10人) 回复此楼
10楼2009-02-09 20:15:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 amoschen 的主题更新
161/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭