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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 同分异构体能量比较稳定性
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huyingmm

银虫 (正式写手)

[求助] 同分异构体能量比较稳定性 已有2人参与

求助各位懂gaussian计算的同胞，
计算遇到一个问题：本人不太懂计算，但实验时通过质谱确定了反应产物的分子量，但并不确定产物的结构，结果查找文献和分析，最终确定两个结构，分别为Cl原子连接在不同位置的N上，所以这两种可能的产物结构不同但分子量相同。为了分析哪一种结构更稳定，所以就使用Gaussian软件分别画出了这两种可能的构型，分别进行opt+fre构型优化和频率计算。通过多次计算，两种构型得计算结构都达到收敛，且无虚频，构型1比构型2的 HF小0.0064 hartree。问题就出在这，从相关文献可以推断出，构型1应该没有构型2稳定，但计算的结果却无法证明文献的这个推论。
所以接下来我该如何解决这个问题？
1，继续优化两个构型比较能量直到构型1能量大于构型2能量？
2，还是说并不用太在意这个能量差？
3，还是该如何进行下一步？

感谢各位！多多提供思路!
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即使跌倒也要豪迈的笑！
1楼 2017-07-10 16:42:55
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huyingmm

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ra2ghgzh at 2017-07-11 09:22:11
你可能需要使用更复杂的基组，然后比较零点能、焓以及自由能。
另外，如果是比较溶液中的能量还要考虑溶剂效应。

感谢感谢，因为我计算的是非常小的分子，一百多的分子量，基组是B3LYP/6-311++g(d,p)，优化计算时也从小基组算起的，结果都差不多，最后用了这个。估计这个基组够用了。
想问下，比较零点能、焓和自由能的目的是什么？通过比较能得出什么结果？
另外如何考虑溶剂效应？
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即使跌倒也要豪迈的笑！
4楼2017-07-12 20:53:56
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wangf44

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
2楼2017-07-10 17:27:14
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ra2ghgzh

木虫 (正式写手)

学痴
你可能需要使用更复杂的基组，然后比较零点能、焓以及自由能。
另外，如果是比较溶液中的能量还要考虑溶剂效应。
赞一下(1人) 回复此楼
我永远当不了老板
3楼2017-07-11 09:22:11
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huyingmm

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wangf44 at 2017-07-10 17:27:14
文献推测2比1稳定的理由是什么？另外，0.006Hartree非常小了，光看总能量可能意义不大吧。动力学稳定性呢？就是说可能发生的反应上看呢？

感谢感谢，文献推测是因为这一类物质有几篇文章，确定的产物是产物2的相似结构，并没有提出产物1类，产物1是我们自己讨论时提出来的可能性产物。
如果说0.006已经很小了，那就是能量相当，那就是也可不将计算结果作为产物支持的证据。关于动力学的稳定性上，接下来正准备计算下反应路径，定量的看看反应路径。
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即使跌倒也要豪迈的笑！
5楼2017-07-12 21:02:06
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