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nico910902铜虫 (小有名气)
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[求助]
关于VASP并行计算的服务器配置，想购入刀片或机架式服务器已有2人参与
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大家好，小弟接触VASP有一段时间，但是大部分计算都在4核8线程服务站上单机并行。由于最近需要计算的模型略大所以想配置一台服务器，刀片式或者机架式100核左右。 请问有哪位大神有相关方面的研究吗,现有以下一些问题，希望有大神相助: 1. VASP的并行计算速度跟哪些因素最相关？（内存，核心数，核心频率...） 2. 目前有两个方案，a 购入10台机架式服务器（双处理器/台，4核2.6GHz/处理器，内存16G/台）组成一个集群；b 直接购入1台刀片式服务器 （拥有10-16个刀片，每个刀片配置与a方案中配置相当，只是频率为2.5GHz）。请问哪种方案更适合VASP并行计算？其实归根结底就是刀片式服务器和机架式服务器的对比以及vasp并行原理的理解。需要考虑服务器搭建，系统软件安装难度等综合因素。。因为这些都需要自己搞而小弟又对编程并不是特别在行，不想浪费太多时间在上边。但是哪位大神有相关学习资料的话非常希望能传给小弟拜读。 3. 对于以上两种方案，12G-16G/台的内存足够吗？小弟主要做一些第一原理分子动力学计算用以拟合一些合金的势函数。 4. VASP在服务器上的编译和在单机上的编译方法相同吗？ 求赐教  |
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3楼2017-07-04 10:02:12
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1. VASP的并行计算速度跟CPU核心数，CPU主频相关，还需要根据你计算体系大小配置内存大小。 2. 机架式服务器与刀片式服务器本质上一样。建议你找一家对VASP深刻理解的高性能计算集群厂商，提供匹配的配置方案，以及后继集群搭建和维护，特别是VASP在集群上的编译和使用培训。 3. 根据你计算体系大小配置内存大小。 4. 大同小异，建议找VASP等编译、使用的技术支持。 |
4楼2017-07-04 10:49:57