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钱塘幼麟

木虫 (著名写手)

[求助] PCR扩增约6000bp质粒,一直失败 已有7人参与

准备用Gibson Assembly Mix把一个片段插入一个质粒,所以在这个操作前,先用PCR把同源臂扩入这个质粒。质粒全长6000bp多。PCR中,使用Q5-HF, 25微升推荐的体系。正向引物TM59.2. 反向引物TM54.2。程序如下:98度30秒, 98度30秒,50-58度梯度7分,72度30秒,72度10分,6度无限长hold。

最后扩增出来的条带图如下:全部积在槽子里。不知道怎么回事,求指点。

PCR扩增约6000bp质粒,一直失败
ChemiDoc MP 2017-06-29 13hr 35min(new linker primers for 1b and 2b vector).jpg
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冯丽妍fly

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
退火和延伸的时间是不是弄反了?延伸的时间1kb 1min,退火时间为30s.
9楼2017-06-30 19:53:01
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伤何处

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-06-29 22:46:20
钱塘幼麟: 金币+5, 有帮助 2017-08-04 17:23:43
没用过Gibson Assembly Mix这个试剂盒。我一般是把载体单酶切或双酶切,然后和两端带有同源序列的PCR产物进行Gibson cloning。如果你是用PCR方法扩增质粒的话,注意你的引物,看看有没有问题。还有就是,你用质粒做模板的话,只需要加几ng的质粒就够了,不需要太多。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

对也罢,错也罢;正也罢,逆也罢;通途也好,崎岖无妨……但问,吾心坚否?若坚,纵使歧路,以铁心,贯穿而过,亦为大道!不坚,便是坦途,也难登临绝顶,观险峰
2楼2017-06-29 20:33:09
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钱塘幼麟

木虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 伤何处 at 2017-06-29 20:33:09
没用过Gibson Assembly Mix这个试剂盒。我一般是把载体单酶切或双酶切,然后和两端带有同源序列的PCR产物进行Gibson cloning。如果你是用PCR方法扩增质粒的话,注意你的引物,看看有没有问题。还有就是,你用质粒做 ...

质粒提取浓度是300多ng每微升,加了0.25微升。

发自小木虫IOS客户端
3楼2017-06-30 08:56:24
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demonhb

新虫 (小有名气)

程序错了吧,怎么会退火时间7分钟,而延伸时间才30秒,反了吧,你这酶不可能30秒能延伸6000bp吧

发自小木虫Android客户端
4楼2017-06-30 09:22:45
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