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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 如何在Dmol3计算固体表面吸附分子的自由能中用Partial Hessian加速
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
10楼: Originally posted by 52Hz的明王星 at 2021-03-06 16:27:07
老师，您好。在vibrational analysis里面就没有虚频存在了。我体系291个原子，只选择了2个原子为partial hessian，但是最终出来了867个频率结果，我要计算ZPE和TS的时候，这些频率都是要考虑的，还是只是挑出我所关 ...

都考虑。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
11楼2021-03-06 16:36:02
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52Hz的明王星

木虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 卡开发发 at 2021-03-06 16:36:02
都考虑。...

老师您好，全都考虑的话，我算了ZPE的结果与输出的ZPE的结果相差很大，我尝试只关注对应的原子的振动的结果反而与程序给出的ZPE很接近
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12楼2021-03-06 16:57:14
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
12楼: Originally posted by 52Hz的明王星 at 2021-03-06 16:57:14
老师您好，全都考虑的话，我算了ZPE的结果与输出的ZPE的结果相差很大，我尝试只关注对应的原子的振动的结果反而与程序给出的ZPE很接近...

程序算出的ZPE是按照outmol打出来的频率算得（虚频部分不算），所以接近只是某种凑巧。之所以建议用Analysis里面的数据是因为analysis里面有把转动部分投影掉。当然大前提也是Analysis作出的频率不能有虚频。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
13楼2021-03-06 19:33:04
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52Hz的明王星

木虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 卡开发发 at 2021-03-06 19:33:04
程序算出的ZPE是按照outmol打出来的频率算得（虚频部分不算），所以接近只是某种凑巧。之所以建议用Analysis里面的数据是因为analysis里面有把转动部分投影掉。当然大前提也是Analysis作出的频率不能有虚频。...

谢谢老师
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14楼2021-03-06 19:36:06
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