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木虫 (小有名气)

[求助] 如何在Dmol3计算固体表面吸附分子的自由能中用Partial Hessian加速

即只对吸附分子做频率分析,基底原子自动忽略,最后给出零点能和室温下的自由能。
这样可以极大的降低计算量。

尝试发现vasp和castep可以通过对基底原子固定坐标的方式来做到这个效果。
dmol3即使固定了坐标也没有用。
使用她的partial hessian功能后能进行频率分析,但是最后不能给出自由能。
说“Thermochemistry is not calculated with Partial Hessian”
有大侠知道如何修改关键字来达到这个效果吗?
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52Hz的明王星

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 卡开发发 at 2021-03-06 15:15:47
看下tool菜单里面的vibrational analysis呢,那个有多少虚频?...

老师,您好。在vibrational analysis里面就没有虚频存在了。我体系291个原子,只选择了2个原子为partial hessian,但是最终出来了867个频率结果,我要计算ZPE和TS的时候,这些频率都是要考虑的,还是只是挑出我所关注的这两个原子的振动模式进行计算?如果我是要挑出来那几个关注的频率结果,有没有比较便捷的方法从这么多数据中找出来呢?谢谢老师的解答。
10楼2021-03-06 16:27:07
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时光唤雨

新虫 (小有名气)

3楼2019-04-18 09:40:16
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时光唤雨

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Ccfreesia at 2018-07-27 14:45:58
同求,顶一下

您好,请问解决了吗

发自小木虫Android客户端
4楼2019-04-18 09:52:13
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52Hz的明王星

木虫 (正式写手)

请问您找到解决的方法了吗?
5楼2021-03-05 11:22:06
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