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clickme木虫 (小有名气)
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如何在Dmol3计算固体表面吸附分子的自由能中用Partial Hessian加速
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即只对吸附分子做频率分析，基底原子自动忽略，最后给出零点能和室温下的自由能。 这样可以极大的降低计算量。 尝试发现vasp和castep可以通过对基底原子固定坐标的方式来做到这个效果。 dmol3即使固定了坐标也没有用。 使用她的partial hessian功能后能进行频率分析，但是最后不能给出自由能。 说“Thermochemistry is not calculated with Partial Hessian”  有大侠知道如何修改关键字来达到这个效果吗？ |
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我的计算结果如下： vibrational frequencies, intensities mode au_amu cm-1 meV THz km/mol 1 -0.028053 -144.2 -17.88 -4.323 0.00 2 -0.020608 -105.9 -13.13 -3.176 0.00 3 -0.015733 -80.9 -10.03 -2.425 0.00 4 -0.011992 -61.6 -7.64 -1.848 0.00 5 -0.009646 -49.6 -6.15 -1.486 0.00 6 -0.005562 -28.6 -3.54 -0.857 0.00 7 0.000000 0.0 0.00 0.000 0.00 8 0.000000 0.0 0.00 0.000 0.00 9 0.000000 0.0 0.00 0.000 0.00 10 0.000000 0.0 0.00 0.000 0.00 后面都是0，但是 零点能可以算出 Zero point vibrational energy: 4.696 kcal/mol |
8楼2021-03-06 14:50:35
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3楼2019-04-18 09:40:16
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