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关于Trizol法提取细菌总rna的问题
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新手用Trizol法提冶金微生物,Leptospirillum菌的总RNA,步骤如下: 1. 收集10ml菌液(含有黄铁矿,细菌吸附与黄铁矿上),10000rpm离心,去除上清,加入10ml含0.1%的Tween-20的培养基,漩涡震荡几分钟,2000rpm离心后,收集上清,上清再12000rpm离心收集菌体。 2. 将菌体收集至1.5ml EP管中,加入1 ml Trizol, 室温5min,充分溶解 3. 按比例200μl 氯仿/1ml Trizol,震荡混匀10-15 s, 室温放置2-3min 4. 4℃离心,12000rpm 15min,小心吸取上清透明液500μL,转移至新的Ep管 (离心后混合物分为三层:下层的红色的苯酚-氯仿层,中间层,上层水样层,其容量为所加Trizol的60%,RNA全存在于水样层中) Note:吸取水样层时,切勿不要吸到中间层,里面溶有DNA;若同时提取DNA和蛋白质,则保留下层酚相,存于4℃冰箱,中间层为蛋白质。 5. 加入等体积的异丙醇,约500μl,上下颠倒混匀,室温放置10min,使RNA析出沉淀。 6. 4℃离心,12000rpm 10min,弃上清,可见白色块状RNA沉于管底,小心弃上清 7. 加入1mL预冷的75%乙醇洗涤沉淀,温和震荡,沉淀悬浮即可 8. 4℃离心 8000rpm 5min,小心弃上清 9. 室温晾干或真空干燥2-5min,待乙醇挥发即可,不要过于干燥 10. 根据沉淀多少,溶于20-200μl DEPC水,用枪头吹打 55℃水浴5min 以溶解沉淀(-80℃可长期保存) 11. 测量浓度及OD值 用这样方法提了好几次RNA了,RNA的浓度都很低,都只有几十纳克每微升,而且260/280的比值也只有不到1.5。后面将菌液提高到50ml,结果也是这样。真是整个人都要奔溃了 !后来买了天根的培养细胞/细菌总RNA提取试剂盒用来提,这个结果更惨,RNA浓度最后只有不到10了。各位虫友,求救~~~~ |
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5楼2017-06-26 08:43:21













!后来买了天根的培养细胞/细菌总RNA提取试剂盒用来提,这个结果更惨,RNA浓度最后只有不到10了。各位虫友,求救~~~~
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大雪年华