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大雪年华

木虫 (小有名气)

[求助] 关于Trizol法提取细菌总rna的问题

新手用Trizol法提冶金微生物,Leptospirillum菌的总RNA,步骤如下:
1.        收集10ml菌液(含有黄铁矿,细菌吸附与黄铁矿上),10000rpm离心,去除上清,加入10ml含0.1%的Tween-20的培养基,漩涡震荡几分钟,2000rpm离心后,收集上清,上清再12000rpm离心收集菌体。
2.        将菌体收集至1.5ml EP管中,加入1 ml Trizol, 室温5min,充分溶解
3.        按比例200μl 氯仿/1ml Trizol,震荡混匀10-15 s, 室温放置2-3min
4.        4℃离心,12000rpm 15min,小心吸取上清透明液500μL,转移至新的Ep管
(离心后混合物分为三层:下层的红色的苯酚-氯仿层,中间层,上层水样层,其容量为所加Trizol的60%,RNA全存在于水样层中)
Note:吸取水样层时,切勿不要吸到中间层,里面溶有DNA;若同时提取DNA和蛋白质,则保留下层酚相,存于4℃冰箱,中间层为蛋白质。
5.        加入等体积的异丙醇,约500μl,上下颠倒混匀,室温放置10min,使RNA析出沉淀。
6.        4℃离心,12000rpm 10min,弃上清,可见白色块状RNA沉于管底,小心弃上清
7.        加入1mL预冷的75%乙醇洗涤沉淀,温和震荡,沉淀悬浮即可
8.        4℃离心 8000rpm 5min,小心弃上清
9.        室温晾干或真空干燥2-5min,待乙醇挥发即可,不要过于干燥
10.        根据沉淀多少,溶于20-200μl DEPC水,用枪头吹打
55℃水浴5min 以溶解沉淀(-80℃可长期保存)
11.        测量浓度及OD值

用这样方法提了好几次RNA了,RNA的浓度都很低,都只有几十纳克每微升,而且260/280的比值也只有不到1.5。后面将菌液提高到50ml,结果也是这样。真是整个人都要奔溃了!后来买了天根的培养细胞/细菌总RNA提取试剂盒用来提,这个结果更惨,RNA浓度最后只有不到10了。各位虫友,求救~~~~
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阳yang洒洒

新虫 (初入文坛)

我提昆虫的触角也是这样,刚开始是浓度和OD比值不行,提了很多次,现在是浓度不行。拿去测转录组,公司检测的更低,降解了。

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2楼2017-06-25 19:13:48
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大雪年华

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 阳yang洒洒 at 2017-06-25 19:13:48
我提昆虫的触角也是这样,刚开始是浓度和OD比值不行,提了很多次,现在是浓度不行。拿去测转录组,公司检测的更低,降解了。

你也是用Trizol法提的吗?你的纯度是怎么提高的?
3楼2017-06-25 21:57:17
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阳yang洒洒

新虫 (初入文坛)

是trizol的方法,我现在的浓度还是不行,今天加大样品的量试试

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2017-06-26 08:08:12
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大雪年华

木虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 阳yang洒洒 at 2017-06-26 08:08:12
是trizol的方法,我现在的浓度还是不行,今天加大样品的量试试

共勉共勉
5楼2017-06-26 08:43:21
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阳yang洒洒

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 大雪年华 at 2017-06-26 08:43:21
共勉共勉...

你的提出来了吗?

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6楼2017-07-04 09:30:06
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仔仔想毕业

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 阳yang洒洒 at 2017-06-25 19:13:48
我提昆虫的触角也是这样,刚开始是浓度和OD比值不行,提了很多次,现在是浓度不行。拿去测转录组,公司检测的更低,降解了。

同问,纯度怎么提上来,我现在比值还在1.4左右,不知道什么原因

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7楼2017-07-18 21:59:19
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