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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何计算药物分子与蛋白相互作用的结合距离
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majinjie2001

银虫 (正式写手)

[交流] 如何计算药物分子与蛋白相互作用的结合距离

本人现在在做药物分子与BSA的相互作用，其中有一个参数为结合距离
目前参考文献上都是用蛋白的荧光光谱与药物分子的吸收光谱作图后，计算两者的重叠积分
但是由于有两个坐标轴，而且刻度不一致，不知道应该按照那个计算积分面积呢？
积分面积是用什么软件求出来的呢？
希望做过这方面工作的朋友不吝赐教，先谢过了
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1楼 2009-01-16 19:52:00
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richard58272

金虫 (正式写手)
★ ★
lwf991229(金币+2):感谢参与讨论~欢迎常来~ 1-19 18:11
最好有两条曲线的数据，这样就可以直接在excel中作图求积分了。当然，很多其他的软件也可以求积分，比如Matlab、Origin等。
关于小分子与蛋白质结合的距离问题，你最好向做药物对接的人求助。
我是用统计方法预测蛋白质相互作用的。

[ Last edited by richard58272 on 2009-1-19 at 16:38 ]
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2楼2009-01-19 16:37:20
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majinjie2001

银虫 (正式写手)
经证实，文献上的图有误，应该是把萤光强度和紫外吸收都归一后才能够经行重叠计算，否者无法计算，哎，中文文献害人啊
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3楼2009-03-01 16:12:42
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